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内蒙古自治区呼和浩特市赛罕区大学西街235号 邮编: 010021
作者机构:内蒙古农业大学兽医学院/农业农村部动物疾病临床诊疗技术重点实验室呼和浩特010018 山东省诸城市畜牧兽医管理局山东诸城262200 内蒙古自治区农牧业科学院呼和浩特010031 内蒙古阿拉善盟畜牧兽医工作站内蒙古阿拉善750306
出 版 物:《黑龙江畜牧兽医》 (Heilongjiang Animal Science And veterinary Medicine)
年 卷 期:2018年第23期
页 面:21-26页
学科分类:0710[理学-生物学] 090601[农学-基础兽医学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种]
基 金:国家重点研发计划项目(2017YFD0501200) 国家自然科学基金项目(31460656) 内蒙古自然科学基金项目(2014MS0339 2015MS0308) 家畜疫病病原生物学国家重点实验室开放基金项目(SKLVEB2017KFKT010 SKLVEB2015KFKT013)
主 题:少孢节丛孢菌 Aoz1基因 PCR 启动子 生物信息学分析 启动子预测
摘 要:为了确定少孢节丛孢菌内蒙古株丝氨酸蛋白酶Aoz1基因的潜在启动子区,试验采用透析膜培养的方法培养出少孢节丛孢菌内蒙古株并提取基因组DNA,与NCBI上Aoz1基因进行比对,选定Aoz1基因上游侧翼长度为2 000 bp的序列(命名为AP1)并据此设计引物,用PCR法扩增该序列并构建至平末端载体后测序,使用启动子在线预测软件Web Promoter Scan Service、NNPP以及CpG岛预测软件EMBOSS对AP1进行生物信息学分析。结果表明:所提取的基因组DNA完整性良好;成功构建出重组平末端质粒PEASY-AP1-Blunt,测序结果正确;通过相应软件预测出AP1含有的启动子基本元件,如TATA框、转录起始位点(TSS位点),以及参与Aoz1基因表达调控的转录因子结合位点Sp1、GHO、E2F、T-Ag和GCF等,同时确定了CpG岛的Obs/Exp值与GC含量的百分比分布。说明AP1序列具有启动子的基本结构和特点,初步确定了少孢节丛孢菌Aoz1基因的潜在启动子区。