菲律宾蛤仔RP2基因的克隆及组织表达分析

作     者：裴爱君 杨艳津 秦艳杰 赵祥吉 闫喜武 李霞 王福景 PEI Ai-jun;YANG Yan-jin;QIN Yan-jie;ZHAO Xiang-ji;YAN Xi-wu;LI Xia;WANG Fu-jing

作者机构：大连海洋大学辽宁省贝类良种繁育工程技术研究中心辽宁大连116023 

出 版 物：《大连海洋大学学报》 (Journal of Dalian Ocean University)

年 卷 期：2015年第30卷第2期

页      面：132-137页

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-48) 

主　　题：菲律宾蛤仔 视网膜色素变性基因2 分子克隆 组织表达分析 

摘      要：采用反转录PCR(RT-PCR)与c DNA末端快速克隆(RACE)法首次从壳长为28 mm的菲律宾蛤仔Ruditapes philippinarum外套膜中克隆出RP2基因(Gen Bank登录号:KF826881)。结果表明:RP2基因c DNA序列长度为1158 bp,包括62 bp的5 端非编码区,41 bp的3 端非编码区,开放阅读框1053 bp,编码350个氨基酸;推导的氨基酸序列具有TBCC(57aa^175aa)和CARP(65aa^102aa)保守结构域,并为非跨膜糖蛋白;经Blast同源性比较表明,菲律宾蛤仔RP2氨基酸序列与太平洋牡蛎Crassostrea gigas的相似性较高(56%),与高等哺乳动物、鸟类、鱼类、两栖类和节肢动物各模式动物之间的相似性为43%~53%,与非洲眼线虫Loa loa的相似性较低(33%);利用实时定量PCR技术检测RP2基因在菲律宾蛤仔不同组织中的表达,结果显示,RP2基因在菲律宾蛤仔雄性性腺中表达量最高,在鳃、水管和外套膜组织中次之,在斧足和闭壳肌中表达量极少,在雌性性腺中无表达。研究表明,RP2基因在菲律宾蛤仔各组织中的表达较为广泛,但不同组织的表达量存在明显差异,本研究结果可为无脊椎动物RP2基因的结构及其功能研究提供基础数据。