25株SIV/HIV的进化分析及意义

作     者：袁伟 吴宏宇 黄青山 YUAN Wei;WU Hong-yu;HUANG Qing-shan

作者机构：复旦大学生命科学学院遗传学研究所遗传工程国家重点实验室上海200433 上海高科联合生物技术研发有限公司上海201206 

出 版 物：《复旦学报（自然科学版）》 (Journal of Fudan University：Natural Science)

年 卷 期：2006年第45卷第3期

页      面：303-308,315页

核心收录：

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

主　　题：SIV HIV 进化分析 Neighbor-Joining方法 Maximum Likelihood方法 

摘      要：选取了16株SIV和9株HIV毒株,以人T细胞白血病病毒HTLV-1为outgroup,使用CLUSTAL X、PHYLIP及MEGA三种软件对它们的基因组序列及三个主要蛋白(Env,Gag,Pol)序列分别进行了比对分析,用Neighbor-Joining(N-J)方法和Maximum Likelihood(ML)方法分别构建出进化树.结果显示HIV起源于SIV,其中HIV-1的起源与SIVcpz的几种亚型高度相关,HIV-2的起源与SIVsm及SIVmm高度相关.