果蔗Hsp90基因的电子克隆及序列分析

作     者：林生 潘大仁 周以飞 陈观水 张绪璋 张燕云 Lin Sheng;Pan Daren;Zhou Yifei;Chen Guanshui;Zhang Xuzhang;Zhang Yanyun

作者机构：福建农林大学作物学院福建省作物分子与细胞生物学重点实验室福州350002 福建农林大学作物学院作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室福州350002 

出 版 物：《热带作物学报》 (Chinese Journal of Tropical Crops)

年 卷 期：2009年第30卷第12期

页      面：1824-1830页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家自然科学基金(No.30370900) 福建省自然科学基金(No.2003N001)资助 

主　　题：果蔗 HSP90基因 电子克隆 生物信息学 

摘      要：以克隆到的果蔗HSP90基因片段作为探针,利用电子克隆和序列拼接方法获得一个全长为2097bp的cDNA序列。通过ORF软件分析,预测得到的蛋白质具有698个氨基酸。应用生物信息学对果蔗HSP90蛋白的理化性质、二级结构、疏水性/亲水性、信号肽、功能结构域分析及其蛋白功能、高级结构和同源性进行了预测分析。结果表明,该蛋白的相对分子量为80.2ku,在N端有一个ATP结合位点,具有内源ATPase活性。序列分析表明,该蛋白可能具有信号转导、转录调控、胁迫应答、生长因子等功能。利用梢腐病病原Gibberella fujikuroi接种果蔗福安叶片,检测到HSP90基因的转录水平逐渐提高。