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基于SRAP分子标记的海南沼虾种群遗传多样性

Genetic diversity in five Macrobrachium hainanense populations using SRAP markers

作     者:傅洪拓 乔慧 姚建华 龚永生 吴滟 蒋速飞 熊贻伟 Hongtuo Fu;Hui Qiao;Jianhua Yao;Yongsheng Gong;Yan Wu;Sufei Jiang;Yiwei Xiong

作者机构:中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部水生动物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室江苏无锡214081 南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081 

出 版 物:《生物多样性》 (Biodiversity Science)

年 卷 期:2010年第18卷第2期

页      面:145-149页

核心收录:

学科分类:0908[农学-水产] 09[农学] 

基  金:国家"十一五"科技支撑计划(2006BAD01A13) 农业部农业科技跨越计划(2007年度) 江苏省高技术研究项目(BG2007328) 

主  题:Macrobrachium hainanense SRAP 遗传多样性 遗传分化 种群遗传结构 

摘      要:为了调查我国海南沼虾(Macrobrachium hainanense)不同地理种群遗传多样性及遗传分化状况,本文采用序列相关扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)标记对我国南方瓯江(OJ)、闽江(MJ)、珠江(PR)、万泉河(WQ)、昌化江(CH)等5个海南沼虾种群的遗传多样性进行了研究。共得到255个清晰、稳定的位点,平均多态位点比例为47.05%,由小到大依次为:PR(43.92%)=WQ(43.92%)MJ(46.67%)CH(47.45%)OJ(53.33%)。遗传杂合度由小到大依次为:PR(0.1657)WQ(0.1763)CH(0.1799)OJ(0.1839)MJ(0.1892),平均为0.1790。Shannon信息指数由小到大依次为:PR(0.2543)WQ(0.2658)CH(0.2746)MJ(0.2846)OJ(0.2876),平均为0.2734。AMOVA分析结果显示,17.64%的遗传变异来自种群间,对总遗传变异影响显著(P0.001)。遗传分化指数(Gst)、基因流(Nm)、遗传距离和聚类分析结果均显示5个海南沼虾种群间已经出现较大的遗传分化。

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