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浙江3个河川沙塘鳢群体线粒体16S rRNA基因序列的研究

Research on Mitochondrial 16S rRNA Genetic Sequence from Three Populations of Odontobutis potamophila in Zhejiang Province

作     者:刘士力 贾永义 迟美丽 蒋文枰 程顺 顾志敏 王雨辰 Liu Shili;Jia Yongyi;Chi Meili;Jiang Wenping;Cheng Shun;Gu Zhimin;Wang Yuchen

作者机构:浙江省淡水水产研究所农业部淡水渔业健康养殖重点实验室/浙江省淡水水产遗传育种重点实验室湖州313001 上海海洋大学水产与生命学院上海201306 

出 版 物:《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期:2018年第37卷第11期

页      面:4742-4748页

核心收录:

学科分类:0908[农学-水产] 09[农学] 

基  金:中国水产科学研究院基本科研业务费(NO.2018HY-XKQ02) 浙江省省属科研院所扶持专项(NO.2017F30037) 湖州市自然科学资金项目(NO.2017YZ05)共同资助 

主  题:河川沙塘鳢 16SrRNA基因 遗传分化 

摘      要:为进一步了解浙江省河川沙塘鳢种质资源现状,通过对建德(JD)、钟管(ZG)的野生群体以及八里店养殖群体(BLD)的线粒体16SrRNA基因片段进行扩增和测定。获得了约590bp的同源序列,其中变异位点72个,占分析位点的12.2%,含有66个简约信息位点,平均转颠换比值为1.83,4种碱基在所得序列中平均含量为A(30.8%)、G(21.1%)、T(23.6%)、C(24.5%),其中A+T含量为54.4%,略高于C+G含量。分子方差分析(AMOVA)显示,群体间的遗传分化系数(FST=0.39347)在0.25以上,具有较高程度的遗传分化。基于邻接法构建的系统发育树和中间连接法构建的单倍型网络图均显示,建德群体单独聚为一支,且与另外两个群体相隔较远。群体中性检验、错配分析表明,钟管群体历史上较为稳定,未曾经历过显著种群扩张,建德群体近期经历过种群扩张。

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