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内蒙古自治区呼和浩特市赛罕区大学西街235号 邮编: 010021
作者机构:郑州师范学院生命科学学院郑州450044 郑州师范学院郑州市生物物种资源研究重点实验室郑州450044
出 版 物:《南方农业学报》 (Journal of Southern Agriculture)
年 卷 期:2018年第49卷第11期
页 面:2193-2197页
学科分类:09[农学] 0904[农学-植物保护] 090402[农学-农业昆虫与害虫防治]
基 金:河南省科技攻关项目(182102310655) 河南省教育厅高等学校重点科研项目(19A180033) 郑州师范学院科技创新团队计划项目(702011)
主 题:小菜蛾 性信息素结合蛋白(PxylPBP2) 性信息素 分子动力学模拟 能量分解
摘 要:【目的】研究小菜蛾性信息结合蛋白(PxylPBP2)与顺-9-十四碳烯酸酯(Z9-14∶Ac)结合的分子动力学模式、结合内驱力及关键作用氨基酸,阐明二者识别的分子机制,为小菜蛾性诱剂的研发和小菜蛾防治提供参考依据。【方法】运用YASARA对PxylPBP2进行同源建模,运用AutoDock 4.2进行PxylPBP2与Z9-14∶Ac的空间结构对接,运用YASARA平台进行分子动力学模拟,运用***模块计算PxylPBP2-Z9-14∶Ac复合物的结合自由能,以Amber12软件包描述结合关键氨基酸,分析PxylPBP2与Z9-14∶Ac的结合模式及相互作用力。【结果】同源建模构建了合理的PxylPBP2空间模型,分子对接结果表明Z9-14∶Ac结合于PxylPBP2结合腔的内部,受体配体间无氢键,1.4 ns时对接复合物收敛平衡;PxylPBP2-Z9-14∶Ac结合自由能为-9.76 kcal/mol;Phe22和Ile104的贡献能量和占总结合自由能的43%。【结论】范德瓦斯力和非极性溶剂力是PxylPBP2与Z9-14∶Ac形成稳定复合物的主要内驱力,能量贡献最大的两个关键氨基酸(Phe22和Ile104)位于侧链上。