PFGE、RAPD、Diversilab及MLST四种分型技术在不动杆菌同源性分析中的应用比较

作     者：刘文静 张小江 杨启文 徐英春 LIU Wenjing;ZHANG Xiaojiang;YANG Qiwen;XU Yingchun

作者机构：中国医学科学院/北京协和医学院/北京协和医院检验科北京100730 

出 版 物：《国际检验医学杂志》 (International Journal of Laboratory Medicine)

年 卷 期：2018年第39卷第24期

页      面：3009-3014,3018页

学科分类：1010[医学-医学技术（可授医学、理学学位）] 10[医学] 

基　　金：中国医学科学院医学与健康科技创新工程资助项目(2016-I2M-1-014) 

主　　题：不动杆菌属 同源性分析 分型 耐药 突变 

摘      要：目的比较几种分型技术在不动杆菌属同源性分析中的应用效果。方法用亚胺培南和美罗培南体外筛选不动杆菌属碳青霉烯类耐药突变菌株,用核糖体DNA扩增片段限制性内切酶分析(ARDRA)进行分子水平鉴定,用PFGE、RAPD、Diversilab及MLST四种分型技术分析亲代敏感菌株和耐药突变菌株的同源性。结果碳青霉烯类亲代敏感株和耐药突变菌株ARDRA结果一致,包含了基因组3型不动杆菌、2型鲍曼不动杆菌及13TU型不动杆菌。采用PFGE、RAPD、Diversilab、MLST 4种方法对菌株进行分型后,发现每个株菌的体外选择耐药突变株和亲代敏感菌株的同源性密切相关;RAPD和Diversilab的分辨力比PFGE差,亲缘关系相近的菌株不能被区分,pu53亲代敏感菌株及其耐药突变菌株与pu61亲代敏感菌株及其耐药突变菌株,PFGE显示2株菌间相差7个条带以上,无亲缘关系;RAPD和Diversilab DNA密切相关;MLST显示,与其他分型方法相比,表现为遗传背景一致的菌株具有相同的ST型,尽管基因组3型不动杆菌gpi PCR和gdhB测序或扩增失败。rpoD非简并引物对基因组13TU型不动杆菌和基因组3型不动杆菌扩增效果不好。结论RAPD和Diversilab适用于实验室快速同源性分析,两者区分不好的再选用PFGE和MLST。