水稻稻曲病菌PCR快速检测技术及应用

作     者：曾蓉 徐丽慧 吴雁 高士刚 刘欣 戴富明 ZENG Rong;XU Li-hui;WU Yan;GAO Shi-gang;LIU Xin;DAI Fu-ming

作者机构：上海市农业科学院生态环境保护研究所/上海市设施园艺重点实验室上海201403 

出 版 物：《上海农业学报》 (Acta Agriculturae Shanghai)

年 卷 期：2018年第34卷第6期

页      面：23-26页

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 090402[农学-农业昆虫与害虫防治] 

基　　金：上海市科技兴农重点攻关项目[沪农科攻字(2015)第4-4号] 上海市农业科学院卓越计划[2018(B-1)] 

主　　题：水稻稻曲病菌 水稻种子 PCR检测 

摘      要：根据NCBI Gen Bank中已登记的水稻稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)的全基因组序列,通过对生物信息学方法获得特异性基因,并根据核苷酸序列设计特异性引物。获得的检测引物UV-788F/UV-788R对所有水稻稻曲病菌具有很好的特异性,通过优化退火温度等反应体系,可稳定扩增出788 bp的目的片段,而其他参考菌株及健康种子均无条带。建立的检测方法对菌株基因组DNA的灵敏度为2 pg/μL。对测试样品基因组DNA扩增结果表明:受检的水稻种子检测到水稻稻曲病菌。研究建立的水稻稻曲病病菌的定性检测方法可实现对菌株的分子鉴定和种子的快速检测。