2016-2017年我国部分地区白斑综合征病毒wsv006的变异分析

作     者：蔡苗 刘庆慧 万晓媛 黄倢 CAI Miao;LIU Qing-hui;WAN Xiao-yuan

作者机构：青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室农业部海水养殖病害防治重点实验室青岛市海水养殖流行病学与生物安保重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所山东青岛266071 水产科学国家级实验教学示范中心上海海洋大学上海201306 

出 版 物：《安徽农业科学》 (Journal of Anhui Agricultural Sciences)

年 卷 期：2018年第46卷第33期

页      面：75-79,103页

学科分类：0906[农学-兽医学] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31672679) 国家重点基础研究发展计划项目(2012CB114401) 现代农业产业技术体系项目(CARS-47) 

主　　题：WSSV wsv006 变异 

摘      要：[目的]了解wsv006蛋白结构变异情况,并进一步为其蛋白功能研究提供参考资料。[方法]以2016和2017年在全国18个地区采集的WSSV阳性样品为模板,采用PCR方法,用特异性引物扩增wsv006基因,经连接转化后进行测序,并对测序结果进行分析。[结果]在2016年的47份样本中有9个样本,包括河北黄骅、山东日照、河北沧州和河北唐山4个地区的样本中出现了wsv006目的条带,检出率为19%。在2017年的39份WSSV阳性样本中有16个样本,包括福建霞美镇、河北黄骅、广东湛江、山东滨州、山东东营和上海6个地区的样本中出现了wsv006的目的条带,检出率为41%。氨基酸序列比对结果显示,扩增的wsv006编码氨基酸变异包括氨基酸替换、插入、缺失和提前终止翻译,其中插入的主要是脯氨酸(P)和苏氨酸(T),插入位点在第151～166位,处于PT的交叉重复区域;终止翻译是由于核苷酸第541位插入了GAGG,在转录过程中形成了终止密码子。[结论]wsv006氨基酸序列存在明显变异。