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基于基因本体的相似度计算方法

Computation method for semantic similarity based on gene ontology

作     者:荣河江 王亚东 RONG Hejiang;Wang Yadong

作者机构:哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院哈尔滨150001 

出 版 物:《智能计算机与应用》 (Intelligent Computer and Applications)

年 卷 期:2019年第9卷第1期

页      面:108-113,118页

学科分类:1305[艺术学-设计学(可授艺术学、工学学位)] 13[艺术学] 081104[工学-模式识别与智能系统] 08[工学] 0804[工学-仪器科学与技术] 081101[工学-控制理论与控制工程] 0811[工学-控制科学与工程] 

主  题:基因本体 语义相似性 信息量 

摘      要:对基因或基因产物功能上的相似性的研究是生物信息学关注的热点。基因本体数据描述了基因和基因产物的属性,基于基因本体术语相似度的研究对基因功能的分析、比较和预测具有重要意义。本文研究了基于基因本体的语义相似度计算方法,基于信息量的计算方法,结合最低和最近公共祖先节点,提出了一种改进的相似度计算方法。通过相似度值与专家打分结果相比较的方法进行评价,实验结果表明本方法比传统方法更有效。

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