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内蒙古自治区呼和浩特市赛罕区大学西街235号 邮编: 010021
作者机构:介观化学教育部重点实验室、南京大学化学化工学院理论与计算化学研究所南京210093
出 版 物:《中国科学(B辑)》 (Science in China(Series B))
年 卷 期:2009年第39卷第11期
页 面:1566-1566页
核心收录:
学科分类:081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 070303[理学-有机化学] 0703[理学-化学]
主 题:可极化力场 分子片量子化学计算方法 血红蛋白 相互作用
摘 要:本文应用传统的FF03力场、基于分子片的可极化力场模型以及基于能量的分子片量子化学方法,在B3LYP/6-31G(d)计算水平下,研究了乙酸负离子(CH3COO-)与血红蛋白α亚基在4个作用靶点位(Lys16、Lys90、Arg92和Lys127)的相互作用.可极化力场模型得到的相互作用能大小顺序为:Arg92Lys127Lys90Lys16.通过分析每个分项对结合能的贡献发现,长程静电作用及立体效应共同控制CH3COO-与血红蛋白的结合.