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内蒙古自治区呼和浩特市赛罕区大学西街235号 邮编: 010021
作者机构:中国科学院分离分析化学重点实验室 国家色谱研究分析中心 中国科学院大连化学物理研究所辽宁 大连 116023 中国科学院大学北京 100049
出 版 物:《色谱》 (Chinese Journal of Chromatography)
年 卷 期:2014年第32卷第4期
页 面:376-380页
核心收录:
学科分类:081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 070302[理学-分析化学] 0703[理学-化学]
基 金:国家自然科学基金委员会创新研究群体科学基金(21321064)
摘 要:赖氨酸胍基化在蛋白质组学定性和定量研究中起着重要作用,本文系统分析了胍基化前后,HeLa细胞蛋白质经胰蛋白酶酶解产生的3种不同类型肽段的质谱鉴定情况,并探讨了不同肽段质谱响应改变的内在原因。发现赖氨酸在侧链能选择性地发生胍基化反应(其选择性达到96.8%),转化为高精氨酸,碱性增强。因此在正离子质谱模式下,C端为赖氨酸的肽段产生了更多的y离子,提供了许多新的离子碎片信息。在鉴定结果中,此类肽段所占总肽段的比例由原来的51.7%上升为57.3%,并且有1 015条新的肽段被检测到。对于不含有赖氨酸的肽段,其鉴定结果在胍基化前后基本没有变化。结果表明,胍基化可以在一定程度上提高质谱鉴定的灵敏度和互补性,提高蛋白质分析的覆盖率。