一种位点注释的蛋白质数据库用于磷酸化肽段的鉴定

作     者：程凯 王方军 边阳阳 叶明亮 邹汉法 CHENG Kai;WANG Fangjun;BIAN Yangyang;YE Mingliang;ZOU Hanfa

作者机构：中国科学院分离分析化学重点实验室中国科学院大连化学物理研究所国家色谱研究分析中心辽宁大连116023 中国科学院大学北京100049 

出 版 物：《色谱》 (Chinese Journal of Chromatography)

年 卷 期：2015年第33卷第1期

页      面：10-16页

核心收录：

学科分类：081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 070302[理学-分析化学] 0703[理学-化学] 

基　　金：国家自然科学基金委员会创新研究群体科学基金项目(21321064) 国家重点基础研究发展计划项目(2013CB911202) 

主　　题：蛋白质组学 磷酸化 检索空间 位点注释 

摘      要：磷酸化修饰的分析一直是蛋白质组学研究的热点之一。在鸟枪法的蛋白质组学研究中,通过在数据库检索中设定磷酸化为可变修饰可以直接鉴定磷酸化修饰的位点。但是翻译后修饰的引入会增加数据检索空间,造成鉴定灵敏度的降低。为了解决这一问题,我们构建了一种位点注释的数据库,这种数据库包含蛋白质的磷酸化位点信息,并开发了一种新的数据库检索策略用于磷酸化肽段的可靠鉴定。用不同类型的数据作为分析对象,通过Mascot检索软件对这种新的数据库检索策略进行了考察,证明了这种方法在保证鉴定结果可靠性的前提下提高了磷酸化肽段鉴定的灵敏度。