黄梁木实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择

作     者：张登 李景剑 张梦洁 包钰韬 杨霄 徐武云 欧阳昆唏 陈晓阳 Deng Zhang;Jingjian Li;Mengjie Zhang;Yutao Bao;Xiao Yang;Wuyun Xu Kunxi Ouyang;Xiaoyang Chen;Deng Zhang

作者机构：华南农业大学林学与风景园林学院广东省森林植物种质创新与利用重点实验室 

出 版 物：《植物学报》 (Chinese Bulletin of Botany)

年 卷 期：2018年第53卷第6期

页      面：829-839页

核心收录：

学科分类：0907[农学-林学] 08[工学] 0829[工学-林业工程] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金(No.31600525) 广东省科技计划(No.2017B020201008) 

主　　题：黄梁木 实时荧光定量PCR 内参基因 

摘      要：为筛选黄梁木(Neolamarckia cadamba)实时定量PCR最佳内参基因,该研究以黄梁木的根、芽、叶、花、果、皮及形成层为材料,利用RT-qPCR技术对ACT、CAC、CYP和EF1α等21个管家基因家族43个候选内参基因进行表达量分析,并利用geNorm、NormFinder和BestKeeper软件进行内参基因稳定性分析。geNorm的分析结果显示,UPL基因的稳定性最高(M=0.443),UBQ基因的稳定性最低(M=2.859);NormFinder的分析结果显示,UPL基因的稳定性最高(E=0.223),UBQ基因的稳定性最低(M=4.759);BestKeeper分析显示,UPL基因的标准偏差(SD=0.513)最低。研究结果表明,UPL基因作为内参基因稳定性最高,UBQ基因的稳定性最低。因此可以选择UPL基因作为黄梁木不同组织中RT-qPCR定量分析的内参基因。