红笛鲷IRAK-4基因cDNA全长的克隆及组织表达分析

作     者：黄郁葱 鲁义善 简纪常 吴灶和 HUANG Yu-cong;LU Yi-shan;JIAN Ji-chang;WU Zao-he

作者机构：中国科学院南海海洋研究所广东广州510301 中国科学院大学北京100049 广东海洋大学水产学院广东湛江524088 广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室广东湛江524088 仲恺农业工程学院广东广州510225 

出 版 物：《广东海洋大学学报》 (Journal of Guangdong Ocean University)

年 卷 期：2015年第35卷第1期

页      面：18-27页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 071002[理学-动物学] 

基　　金：十二五国家科技支撑计划(2012BAD17B03) 广东省海洋经济创新发展区域示范专项(GD2012-B01-004) 国家自然基金(41240041) 

主　　题：红笛鲷 IRAK-4 基因克隆 组织表达 

摘      要：白细胞介素-1受体相关激酶4（interleukin-1 receptor-associated kinase 4,IRAK-4）是一种参与机体先天性免疫和适应性免疫反应过程中的关键分子。采用RT-PCR和c DNA末端快速扩增（RACE-PCR）的方法从红笛鲷（Lutjanus sanguineus）头肾中克隆IRAK-4基因的c DNA全序列（登录号：KF279357）。该序列全长2 015 bp,包含5′非编码区（5′UTR）205 bp,3′非编码区（3′UTR）421 bp,开放阅读框（ORF）1 389 bp,编码462个氨基酸。根据推导的氨基酸序列预测其蛋白分子质量为52.0 ku,理论等电点为5.19。氨基酸序列比对结果显示,红笛鲷IRKA-4基因氨基酸序列与其他物种的同源性为54.2%~85.7%。系统进化分析结果显示,红笛鲷与斜带石斑鱼（Epinephelus coioides）聚为一支,两者有较近的亲缘关系。用荧光定量PCR分析红笛鲷基因的组织表达差异,红笛鲷IRKA-4基因在各组织中均有不同程度的表达,其中在皮肤、肝脏和胃中表达量最高,其次是胸腺、鳃、心脏、肠、肌肉和脾脏,在头肾、后肾和脑的表达量最低。