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烟草赤星病菌遗传多样性ISSR和RAPD标记比较分析

Comparison Analysis of ISSR and RAPD Molecular Methods Used for Assessment of Genetic Diversity in Alternaria alternate

作     者:胡中会 赵立华 孔宝华 陈海如 范静华 刘飞 李小鹏 蔡红 杨根华 秦西云 方敦煌 Hu Zhonghui;Zhao Lihua;Kong Baohua;Chen Hairu;Fan Jinghua;Liu Fei;Li Xiaopeng;Cai Hong;Yang Genhua;Qin Xiyun;Fang Dunhuang

作者机构:云南农业大学植物保护学院 云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室昆明650201 云南省烟草农业科学研究院云南玉溪653100 

出 版 物:《中国农学通报》 (Chinese Agricultural Science Bulletin)

年 卷 期:2011年第27卷第24期

页      面:262-267页

学科分类:0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 07[理学] 

基  金:中烟公司科技计划项目"烟草病虫害智能远程诊断及GIS监测预警系统研究及应用"(09YN005) 中烟公司科技计划项目"中国烟草主要病虫害标本资源库的构建"(2010YN18) 中烟公司科技计划项目"云南烟草有害生物调查研究"(2010YN19) 

主  题:烟草赤星病 ISSR RAPD 遗传多样性 

摘      要:对分离出的链格孢菌株用ISSR和RAPD分子标记技术分析研究其遗传多样性,比较2种分子生物学方法在链格孢遗传分析中的优劣,为研究烟草赤星病菌遗传多样性及烟草抗病品种的培育奠定基础。采用ISSR和RAPD分子标记方法对来自不同地区的28份烟草赤星病菌进行遗传多样性分析,筛选出10个ISSR引物和10个RAPD引物;ISSR扩增出多态性条带112条,多态性条带比率为86.82%,菌株间相似性系数为0.53~0.97;RAPD引物扩增出多态性条带70条,多态性条带比率为81.39%,菌株间相似性系数为0.57~0.94。用SPSS17.0软件对2种标记遗传距离进行相关性分析,发现2种分子标记结果呈显著正相关,表明2种分子标记方法都适合于烟草赤星病菌遗传多样性研究,ISSR是一种多态性优于RAPD的标记技术。根据2种标记的结果,利用NTSYS软件按UPGMA方法进行聚类分析,发现烟草赤星病菌遗传多样性与地理差异没有显著相关性。

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