太湖日本沼虾的遗传多样性分析

作     者：吴滟 傅洪拓 李家乐 龚永生 李明爽 WU Yan;FU Hong-tuo;LI Jia-le;GONG Yong-sheng;LI Ming-shuang

作者机构：中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部水生动物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室江苏无锡214081 南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081 上海海洋大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室上海200090 

出 版 物：《上海水产大学学报》 (Journal of Shanghai Fisheries University)

年 卷 期：2008年第17卷第5期

页      面：620-624页

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室开放课题基金(KFT2006-8) 国家“十一五”科技支撑计划(2006BAD01A13) 

主　　题：日本沼虾 太湖水域 遗传多样性 RAPD分析 

摘      要：利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对太湖湖区不同水域(无锡、宜兴、苏州及湖州水域)野生日本沼虾群体进行基因组DNA的遗传多样性分析。在事先优化的条件下,试验从选用的50个随机引物中筛选出16个有效引物,共检测到117个清晰稳定的位点,大小为200bp～2000bp,其中92个位点具有多态性。四个群体的多态位点比例分别为49.57%、60.68%、53.85%、57.26%,杂合度为0.2077～0.2163,Shannon信息指数为0.2967～0.3053,群体间遗传分化指数Gst值为0.1644～0..2002。AMOVA分析结果显示,群体的遗传变异有16.67%是由群体间遗传变异引起的,显著性检验表明群体间遗传变异对总遗传变异影响显著。遗传距离显示四个群体有一定遗传分化,其中苏州和宜兴群体间遗传距离最大(0.1481),无锡与宜兴群体间遗传距离最小(0.1141)。利用UPGMA进行聚类分析表明,无锡与宜兴群体首先聚在一起,湖州与苏州群体随后聚在一起,再与无锡、宜兴群体聚在一起。