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A型肉毒神经毒素(BoNT/A)基因序列分析及其B细胞表位预测

Analysis of genome sequence of Clostridium botulinum neurotoxin type A and its prediction of related B cell epitopes

作     者:贾杨 阮承迈 王景林 JIA Yang;RUAN Cheng-mai;WANG Jing-lin

作者机构:军事医学科学院微生物流行病学研究所病原微生物与生物安全国家重点实验室北京100071 军事医学科学院药物毒物研究所新药设计中心北京100850 

出 版 物:《生物信息学》 (Chinese Journal of Bioinformatics)

年 卷 期:2006年第4卷第2期

页      面:53-56,61页

学科分类:0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 07[理学] 071005[理学-微生物学] 10[医学] 

基  金:国家自然科学基金资助项目(30370081) 

主  题:肉毒梭菌 肉毒神经毒素 B细胞表位 

摘      要:比较GenBank中4个不同毒株的A型肉毒神经毒素(BoNT/A)的基因组序列,发现其基因序列的一致性高迭92.2%-99.9%。基于保守性高的BoNT/A氨基酸序列,根据BioSun和LaserGene软件包中的表住分析相关参数,辅以对BoNT/A蛋白的二级结构的分析,综合预测BoNT/A的B细胞表位。结果表明,BoNT/A轻链的142-150、284-292区段,轻链的284-292,重链的440-450、465-480、538-549、699-710、751-760、1087-1095、1224-1231、1263-1270区段是B细胞表位优势区的可能性较大。多参数方案井结合不同软件综合预测BoNT/A蛋白的B细胞表位,为进一步实验鉴定BoNT/A的B细胞表位及其多表位疫苗设计和研究奠定了基础。

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