虾夷马粪海胆微卫星标记制备及对3个养殖群体的遗传多样性分析

作     者：丁君 李润玲 常亚青 孙效文 DING Jun;LI Run-ling;CHANG Ya-qing;SUN Xiao-wen

作者机构：大连水产学院农业部海洋水产增养殖学与生物技术重点开放实验室辽宁大连116023 

出 版 物：《分子科学学报》 (Journal of Molecular Science)

年 卷 期：2008年第24卷第3期

页      面：173-179页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家"863"计划项目(2006AA10A411) 

主　　题：虾夷马粪海胆 微卫星 遗传多样性 

摘      要：通过磁珠富集法分离获得了虾夷马粪海胆微卫星DNA序列160个．其中完美型108个（67．50％），非完美型33个（20．63％），复合型19个（11．88％），微卫星DNA序列最多重复次数达到107次．根据这些微卫星DNA序列的两翼序列，采用Primer5软件设计出虾夷马粪海胆的微卫星引物，通过筛选，采用其中的12对微卫星DNA标记对大连凌水群体（DL）、大连獐子岛群体（DZ）、山东荣城群体（SR）3个虾夷马粪海胆养殖群体的遗传多样性进行分析，共获得73个等位基因，不同引物获得的等位基因数为1．11个，片段大小为84．362bp．除SUX001位点外，其余位点的PIC值在0．2640．0．6705之间，3个群体的平均观测杂合度分别为0．4618（DL），0．4375（SR）和0．4340（DZ），平均期望杂合度分别为0．5026（DL），0．5079（SR）和0．4494（Dz）．Hardy-Weinberg平衡分析显示，73％的被检测位点显著偏离平衡，F-检验显示4个位点的F。值低于0．05，表明群体间存在一定程度的分化．群体间遗传相似性系数、遗传距离及UPGMA聚类分析表明大连獐子岛群体（Dz）与大连凌水群体（DL）群体亲缘关系较近，二者与山东荣成群体（SR）亲缘关系较远．对深入了解我国虾夷马粪海胆养殖群体遗传结构特征及其种质资源状况具有重要意义．