铜绿假单胞菌PAO1株基因组中2个SOS盒序列的初步鉴定

作     者：张克斌 周世文 光丽霞 何晓梅 盛哈雷 张国斌 钱桂生 ZHANG Ke-bin;ZHOU Shi-wen;GUANG Li-xia;HE Xiao-mei;SHENG Ha-lei;ZHANG Guo-bin;QIAN Gui-sheng

作者机构：第三军医大学新桥医院医学实验技术中心重庆400037 第三军医大学新桥医院全军呼吸内科研究所全军呼吸病研究重点实验室重庆400037 

出 版 物：《第三军医大学学报》 (Journal of Third Military Medical University)

年 卷 期：2009年第31卷第11期

页      面：1032-1036页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 071010[理学-生物化学与分子生物学] 081704[工学-应用化学] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 071007[理学-遗传学] 

基　　金：重庆市自然科学基金(2007BB5023) 第三军医大学新桥医院人才基金(2007-2012) 

主　　题：铜绿假单胞菌PAO1株 SOS盒 LexA蛋白 回文序列 凝胶滞后实验 DNase Ⅰ足纹法 

摘      要：目的鉴定铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,PA)PAO1株基因组中的SOS盒序列。方法挑选铜绿假单胞菌PAO1株基因组中16个可能含有SOS盒序列的DNA片段,经PCR扩增后,用纯化的LexA表达蛋白做凝胶滞后实验;将获得的2个阳性DNA片段进一步用DNaseⅠ足纹法进行LexA蛋白结合序列即SOS盒的鉴定;分析所获得的2个SOS盒中的回文序列,以此回文序列在PAO1基因组中进行检索,初步分析出可能的SOS盒序列和可能的调控基因。结果通过DNaseⅠ足纹法初步鉴定了PAO1基因组中2个SOS盒序列,即位于基因组4 052 647～4 052 662 bp位置的CTGTCTACTTATACAG序列和5 349 888～5 349 903 bp位置的CTGTATAAATAACCAG序列,分析其回文结构为CTG…CAG,以此回文序列在基因组中进行检索,共获得了10个候选的SOS盒序列。结论初步证实了PAO1基因组中的2个SOS盒,并获得了10条SOS盒候选序列。