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用文献轮廓挖掘大肠癌转移芯片表达谱

Mining microarray gene expression data of metastatic colorectal cancer by literature profiling

作     者:黄仲曦 孙青 丁彦青 姚开泰 

作者机构:第一军医大学病理教研室肿瘤研究所广东广州510515 

出 版 物:《第一军医大学学报》 (Journal of First Military Medical University)

年 卷 期:2003年第23卷第11期

页      面:1195-1197页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 1002[医学-临床医学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

主  题:大肠癌 肿瘤转移 基因芯片 信息存储 信息检索 基因表达谱 

摘      要:目的寻找新的大肠癌转移相关基因。方法根据大肠癌转移芯片的表达谱,采用基于文献轮廓的数据挖掘方法,从Medline文献数据库中提取基因的相关文献并分析词的频率,再基于重复发生和共发生的过滤标准提取功能相关的词,最后基于词的发生频率对基因进行功能聚类,进一步结合文献及已有的分子生物学检测结果进行分析。结果发现两个新的可能与大肠癌转移相关的基因TIAM1和NM23H1。

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