流感病毒多表位基因盒的设计与预测

作     者：邵京京 丰锋 张强 李虹 李明远 王保宁 李婉宜 SHAO Jing-jing;FENG Feng;ZHANG Qiang;LI Hong;LI Ming-yuan;WANG Bao-ning;LI Wan-yi

作者机构：四川大学华西基础医学与法医学院微生物学教研室四川成都610041 四川大学华西第二医院四川成都610041 

出 版 物：《华西药学杂志》 (West China Journal of Pharmaceutical Sciences)

年 卷 期：2012年第27卷第5期

页      面：486-489页

核心收录：

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金(批准号:30973235) 四川省科技支撑项目(批准号:2010SZ0110) 

主　　题：流感病毒 抗原表位 生物信息学分析 多表位基因盒 

摘      要：目的预测流感病毒抗原表位并设计合成多表位基因盒。方法收集不同类型流感病毒基因序列,联合运用Syf-peithi、ProPred、Multipred2、Bcepred、Clastal X1.83、SWISS-MODEL等多种生物信息学软件进行分析,预测流感病毒Matrix1(M1)、Matrix2(M2)、Nucleoprotein(NP)和HA蛋白上的抗原表位,设计并合成流感病毒多表位基因盒。结果在不同亚型流感病毒的HA蛋白抗原上成功筛选出2个B细胞表位,在M1、M2及NP蛋白上分别筛选出3个T细胞表位,以一定的间隔序列串联各表位,设计并合成流感多表位基因盒。预测结果显示该多表位基因盒具有良好的同源性及抗原性。结论成功设计出包含T细胞表位及B细胞表位的流感病毒多表位基因盒Eg,为流感多表位基因疫苗的研发奠定了基础。