牛CIS基因启动子区SNP及生物信息学研究

作     者：杨永强 龚俞 焦仁刚 惠嫣婷 谢海强 刘若余 

作者机构：贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室贵州贵阳550025 贵州省畜牧技术推广站贵州贵阳550001 

出 版 物：《中国畜牧杂志》 (Chinese Journal of Animal Science)

年 卷 期：2013年第49卷第11期

页      面：9-13页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 090501[农学-动物遗传育种与繁殖] 

基　　金：贵州省重大科技专项计划项目(黔科合重大专项字6009号) 

主　　题：CIS SNP 启动子 贵州荷斯坦奶牛 务川黑牛 

摘      要：为筛选CIS基因启动子区SNP及研究其对启动子功能元件的影响。选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,直接测序筛选SNP位点。结果表明:CIS基因5′调控区3个SNPs位点,分别为G-726A、C-669T、C-82G;生物信息学软件预测得到CIS基因核心启动子区和CpG岛,SNP位点导致附近大量转录因子结合位点消失和新位点产生;多态性位点对转录因子结合位点、RNA二级结构稳定性均有显著影响,但并不改变CpG岛大小。