深低温冻存胃癌样本的核酸与蛋白质质量控制研究

作     者：张佳年 计骏 刘炳亚 朱正纲 傅国辉 于颖彦 Jianian ZHANG;Jun JI;Bingya LIU;Zhenggang ZHU;Guohui FU;Yingyan YU

作者机构：上海交通大学基础医学院病理教研室上海市200025 上海交通大学医学院附属瑞金医院消化外科研究所上海市胃肿瘤重点实验室 

出 版 物：《中国肿瘤临床》 (Chinese Journal of Clinical Oncology)

年 卷 期：2016年第43卷第1期

页      面：27-34页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：国家高技术研究发展计划“863”项目(编号:2012AA02A504,2012AA02A203) 国家自然科学基金项目(编号:81172329,81372644) 上海交通大学医学院转化医学创新基金(编号:15ZH1002,15ZH4001) “985”生物样本库建设基金资助 

主　　题：生物样本 胃癌 低温保存 核酸 蛋白质 质量控制 

摘      要：目的：探索上海市瑞金医院低温冻存0～10年胃癌样本的核酸与蛋白质质量。方法：随机抽取2003年至2014年间库存手术切除胃癌标本24对（共48份）。1％琼脂糖凝胶电泳检测DNA与RNA纯度及完整性，同时增加了RIN值评估法检测RNA完整性；BCA法检测样本蛋白质浓度，考马斯亮蓝法测定蛋白质分子完整性。结果：将组织标本按冻存年限分成四组（〈2年、3～5年、6～8年和〉9年），各组之间DNA完整性差异无统计学意义（P〉0．05），正常胃组织的DNA降解程度比胃癌组织高（P=0．023）；四组之间的RIN值检测显示，冻存6年以上组的RIN值有明显下降（P=0．018）；各组间的蛋白质浓度无显著性差异，考马斯亮蓝法测定蛋白质分子条带完整性存在显著性差异。冻存〉9年组仅出现少量低分子量条带（平均36．5kD），冻存6～8年组尚有中等分子量（平均65．63kD）条带，冻存3～5年组有高分子量（平均127．5kD）条带，冻存短于2年组仍可见大分子量（平均160kD）条带。结论：长期低温冻存对DNA影响最小，超过5年组RNA和大分子量蛋白质降解较多，但中小分子量蛋白质保存完好。