结直肠癌发生发展过程中miRNA 3p、5p臂选择性分析

作     者：包红霞 张家宁 王晓宇 王爽 Bao Hongxia;Zhang Jianing;Wang Xiaoyu;Wang Shuang

作者机构：哈尔滨医科大学药学院基因组中心 哈尔滨商业大学药学院药理学教研室 哈尔滨医科大学药学院生物制药教研室 

出 版 物：《国际遗传学杂志》 (International Journal of Genetics)

年 卷 期：2019年第42卷第1期

页      面：31-34页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：黑龙江省教育厅项目 (12541449)黑龙江省卫生厅科研项目 (2013141)黑龙江省博士后基金 (LBH-Z16128)黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才培养计划 (UNPYSCT-2017068) 

主　　题：结直肠癌 转移 miRNA miR-3p/5p臂 

摘      要：目的 结直肠癌是常见的消化道肿瘤之一,其致病机制复杂。miRNA成熟体来源于前体的3′或5′臂,而这种miRNA臂的选择性与结直肠癌的发生发展是否相关尚不清楚。方法 本研究利用GEO数据库中8例结直肠癌患者正常肠黏膜组织、结直肠癌组织及肝脏转移组织的miRNA二代测序数据。以Bowtie2软件将测序数据与miRNA前体序列进行比对。随后,根据比对位置将miRNA归类为miR-5p或miR-3p,并统计miR-3p和miR-5p的reads数,比较不同组织中miR-3p和miR-5p的分布特点。结果 共检测到来自1442个miRNA前体的miRNA对1057个。在三种组织中miR-3p和miR-5p的比值均能达到0.9以上,且未见差异。在3p和5p总reads分析中发现相比正常组,肝转移组中成对miRNA的3p/5p的reads比值有显著升高。成对miRNA 3p/5p的read比值分析中发现了8个前体来源的miRNA的3p/5p比值在不同组织中出现了统计学差异。结论 miRNA的3p和5p的总reads的比值及多个miRNA的3p、5p reads的比值在疾病不同阶段具有显著的变化,该结果提示miRNA在编辑成熟过程中的3p和5p臂的异常剪切可能与结直肠癌的发生发展密切相关。