中国柯萨奇病毒B5的全基因组测序及其序列分析

作     者：胡永峰 赵丽娜 董杰 吴志强 杜江 薛颖 杨帆 

作者机构：中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒基因工程国家重点实验室北京100052 中国医学科学院病原生物学研究所北京100176 华北煤炭医学院生物科学系唐山063000 

出 版 物：《病毒学报》 (Chinese Journal of Virology)

年 卷 期：2010年第26卷第4期

页      面：283-289页

核心收录：

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

主　　题：手足口病 柯萨奇病毒B5 基因组测序 序列分析 

摘      要：本文对我国首株与手足口病相关的柯萨奇病毒B5(01/CVB5/SD/CHN/09,CVB5/09)进行了基因组测序并与现有的相关序列进行了比较和进化分析。CVB5/09基因组长7399nt,共编码氨基酸2185aa,与现有的CVB5基因组核酸序列相似性在80.6%～85.3%之间,氨基酸序列相似性在96.1%～96.9%。进化分析发现,利用不同的基因组片段P1、P2和P3区构建的进化树中,CVB5/09分别处在不同的进化分支上,不同基因组片段有着不同的进化速率。Simplot相似性分析没有发现基因组有明显的重组发生。本文完成了我国第1株柯萨奇病毒B5全基因组序列的测定,通过与其它相关病毒的比较分析深入了解其遗传特征,以期为手足口病的流行病学调查和预防控制提供有价值的信息。