一条人脑胶质瘤相关新基因的克隆与表达

作     者：祁震宇 惠国桢 张世明 李瑶 周宗祥 顾少华 应康 谢毅 

作者机构：苏州大学附属第一医院神经外科215006 上海复旦大学遗传工程国家重点开放实验室 

出 版 物：《中华神经外科杂志》 (Chinese Journal of Neurosurgery)

年 卷 期：2006年第22卷第2期

页      面：96-100页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

主　　题：基因芯片 脑胶质瘤 融合蛋白 全长新基因 

摘      要：目的运用基因芯片技术获取正常成人脑组织与人脑胶质瘤中差异表达的基因,并对其中一条与脑胶质瘤相关的新基因进行了克隆和表达的研究。方法抽提正常成人脑组织与人脑胶质瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机观察二者表达谱的差异情况,对 681F05克隆子进行了Northern blot,生物信息学分析和蛋白质的表达。结果通过四次基因芯片筛选,获得15条与胶质瘤相关的新基因,经northern blot证实681F05基因在人正常脑组织中低表达, 而在人脑胶质瘤中高表达。BLASTn和BLASTx分析显示,它们编码蛋白与线虫Cyp-10蛋白同源性分别为52％和72％。cDNA序列分析发现这两个克隆是同一个基因[命名为cyclophilin—like gene (PPIL3)]的两个不同的剪切体(PPIL3a和PPIL3b)。并在大肠杆菌中得到了PPIL3a和PPIL3b与 GST较好表达的融合蛋白。结论基因芯片筛选正常脑组织与人脑胶质瘤差异表达的基因具有样品用量少,高质量,高速度,高敏感等特性。681F05基因可能是与人脑胶质瘤形成有关的一条全长新基因。