斯氏副柔线虫SHR基因表达载体的构建及生物信息学分析

作     者：赵学亮 王姝懿 呼和巴特尔 冯陈晨 孙柯 王文龙 ZHAO Xueliang;WANG Shuyi;Huhebateer;FENG Chenchen;SUN Ke;WANG Wenlong

作者机构：内蒙古农业大学兽医学院/农村农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室呼和浩特010018 内蒙古自治区综合疾病预防控制中心呼和浩特010031 

出 版 物：《中国农业大学学报》 (Journal of China Agricultural University)

年 卷 期：2019年第24卷第6期

页      面：116-123页

核心收录：

学科分类：090603[农学-临床兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31260603) 内蒙古自然科学基金项目(2016MS0341) 内蒙古自治区研究生科研创新资助项目(S20171012913) 

主　　题：原核表达载体 SHR基因 抗原表位 生物信息学 

摘      要：为探讨斯氏副柔线虫免疫相关SHR基因作为疫苗候选抗原及早期诊断抗原的可能性,提取斯氏副柔线虫的总RNA,用RT-PCR技术扩增SHR基因,并将PCR产物克隆到pMD19-T载体,构建原核表达载体pET-30a(+)-SHR,利用在线软件对该基因编码蛋白序列进行生物信息学分析。结果表明:克隆获得SHR基因全长1 083 bp,编码360个氨基酸,理论等电点为6.09,无信号肽和跨膜区;磷酸化预测含有29个磷酸化位点;结构分析发现,α-螺旋构成二级结构的主要成分,亲水性氨基酸比例超过60%;抗原表位预测表明,SHR蛋白是一种抗原性较高的亲水性蛋白。推测SHR有望用作斯氏副柔线虫的免疫诊断抗原和疫苗候选抗原。