细胞色素酶2D6的分子对接以及分子动力学研究

作     者：王靖方 张成城 魏冬青 

作者机构：中国科学院上海生命科学研究院系统生物学重点实验室生物信息中心上海200031 上海交通大学生命科学与技术学院生物信息与生物统计系上海200240 

出 版 物：《科学通报》 (Chinese Science Bulletin)

年 卷 期：2010年第55卷第1期

页      面：40-44页

核心收录：

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

基　　金：国家高技术研究发展计划生物信息专项(编号:2007AA02Z333) 国家自然科学基金(批准号:30870476 20773085)资助项目 

主　　题：细胞色素酶 分子对接 分子动力学模拟 药物代谢机理 个性化医疗 

摘      要：细胞色素酶P450是人体内重要的药物代谢酶.通常,这类酶在其结构中都含有一个亚铁血红色分子,并且负责代谢超过90%的已知药物分子.细胞色素酶2D6是这类酶中的重要一员,它负责代谢大约20%～30%的已知药物分子.利用分子对接和分子动力学模拟的方法,研究了细胞色素酶2D6的结构特征以及其与药物分子之间的相互作用.并且发现,细胞色素酶2D6活性位点中的Glu216,Asp301,Ser304和Ala305在其与药物分子的相互作用中有着重要的作用.它们可以形成一个或者多个氢键来固定药物分子.同时其活性位点中的Phe120可以通过形成一定的Π-Π相互作用来识别和固定药物分子.这些发现有助于进一步了解细胞色素酶2D6的结构特征,特别是其活性位点附近的结构特征,理解细胞色素酶2D6代谢药物的机理.同时,由于细胞色素酶2D6存在着单核苷酸多肽性,所得到的结果可以为个性化医疗提供一定的理论基础.