用文献轮廓挖掘鼻咽癌微阵列表达数据

作     者：黄仲曦 姚开泰 

作者机构：第一军医大学病理教研室肿瘤研究所广东广州510515 

出 版 物：《第一军医大学学报》 (Journal of First Military Medical University)

年 卷 期：2004年第24卷第7期

页      面：798-801页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：广东省"十五"专项基金(A1080201) 

主　　题：鼻咽癌 信号通路 微阵列 数据挖掘 生物信息学 

摘      要：目的 探索鼻咽癌异常信号通路。方法 根据鼻咽癌微阵列表达谱,采用基于文献轮廓的数据挖掘方法,从Medline文献数据库中提取与基因相关的文献并分析词的频率,再根据重复发生和共发生的过滤标准提取功能相关的词,最后根据词的发生频率对基因进行功能聚类。结果 基因表达谱的112个差异表达基因聚成16组功能类别:4组暗示EBV感染、6组显示鼻咽癌变过程、2组参与能量代谢、1组提示蛋白的异常磷酸化、2组与其它疾病相关、1组与肌肉组织活性相关。肿瘤发生发展过程中常见的P53和Rb信号通路的异常在本研究中则未发现。结论 鼻咽癌的发生发展可能由特殊的信号通路引起。