基于DNA条形码技术的浮游动物休眠卵种类鉴定:以洞庭湖流域常德柳叶湖为例

作     者：于文波 王庆 魏南 梁迪文 杨宇峰 崔宗斌 YU Wenbo;WANG Qing;WEI Nan;LIANG Diwen;YANG Yufeng;CUI Zongbin

作者机构：暨南大学生态学系广州510632 中国科学院水生生物研究所武汉430072 

出 版 物：《湖泊科学》 (Journal of Lake Sciences)

年 卷 期：2020年第32卷第1期

页      面：154-163页

核心收录：

学科分类：07[理学] 0713[理学-生态学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(41673080,41503072) 淡水生态与生物技术国家重点实验室开放课题(2018FB11)联合资助 

主　　题：浮游动物 休眠卵 DNA条形码技术 COⅠ基因 洞庭湖流域 柳叶湖 

摘      要：以洞庭湖流域的典型城市湖泊常德柳叶湖表层沉积物中浮游动物休眠卵为研究对象,采用DNA条形码技术进行种类鉴定,从191个休眠卵中成功获得101条有效序列,鉴定成功率约为53%.根据NCBI数据库比对成功鉴定休眠卵9科12属11种,另有6个样品鉴定到属或科;3个类群的种间遗传距离平均为种内遗传距离的68倍,表明可以利用线粒体细胞色素c氧化酶第一亚基编码基因(COⅠ)对休眠卵进行有效物种鉴定.通过Neighbor-Joining树进行系统发育分析,发现所鉴定的物种与其参比序列聚类为一支,所有物种分别聚为独立的一个支系,不同物种可有效区分.研究结果均表明,COⅠ基因作为DNA条形码可以实现沉积物中浮游动物休眠卵的物种鉴定.