杂交水稻骨干亲本Wx基因第一内含子+1位碱基多态性分析

作     者：连玲 潘丽燕 朱永生 许惠滨 郑燕梅 何炜 罗曦 王颖姮 蔡秋华 谢华安 张建福 LIAN Ling;PAN Li-yan;ZHU Yong-sheng;XU Hui-bin;ZHENG Yan-mei;HE Wei;LUO Xi;WANG Ying-heng;CAI Qiu-hua;XIE Hua-an;ZHANG Jian-fu

作者机构：福建省农业科学院水稻研究所福建福州350019 农业农村部华南杂交水稻种质创新与分子育种重点实验室/福州(国家)水稻改良分中心/福建省作物分子育种工程实验室/福建省水稻分子育种重点实验室/福建省作物分子育种省部共建国家重点实验室培育基地/水稻国家工程实验室/杂交水稻国家重点实验室华南研究基地福建福州350003 闽江学院海洋研究院海洋生物技术中心福建福州350108 

出 版 物：《福建农业学报》 (Fujian Journal of Agricultural Sciences)

年 卷 期：2019年第34卷第12期

页      面：1355-1363页

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：国家重点研发计划项目(2016YFD0101801) 福建省科技计划公益类专项(2016R1020-8) 

主　　题：Wx基因 第一内含子 碱基多态性 直链淀粉含量 

摘      要：【目的】直链淀粉含量是影响稻米品质的重要因素,而编码颗粒结合型淀粉合成酶(granule-bound starch synthetase,GBSS)的蜡质基因(Wx)是影响直链淀粉含量的主效基因。本研究拟分析120份杂交水稻亲本的Wx基因第一内含子+1位碱基的多态性,以期研究其对内含子的剪接效率及Wx的表达的影响,为亲本育种筛选提供理论参考。【方法】选取120份水稻亲本材料,采用CTAB法提取基因组DNA,并以此为模版PCR扩增Wx基因片段;采用限制性内切酶Acc I对PCR产物进行酶切分析,根据琼脂糖电泳结果分析Wx基因第一内含子+1位碱基类型;同时测定其中19份亲本的直链淀粉含量、胶稠度和碱消值。【结果】PCR扩增结果显示所有材料中均可扩增出清晰且单一的目的条带;PCR产物的Acc I酶切分析结果显示,其中81份亲本的Wx基因第一内含子+1位碱基是T,即为T型,占总数的67.5%,38份亲本为G型,占总数的31.67%,而仅有1份亲本为杂合型,即GT型,占总数的0.83%。19份亲本的直链淀粉含量测定结果表明,7份G型亲本的直链淀粉含量比12份T型亲本的高,且其中6个G型亲本的直链淀粉含量平均值均超过20%。另外,测定结果表明T型亲本和G型亲本的胶稠度和碱消值差别不明显。【结论】120份杂交水稻骨干亲本的Wx基因第一内含子+1位碱基类型测定结果表明,与T型亲本相比,G型亲本的直链淀粉含量明显较高,而胶稠度和碱消值没有明显差别。