许氏平鲉仔鱼、稚鱼、幼鱼肠道微生物群结构特征

作     者：姜燕 曹亚男 柳学周 徐永江 李德军 史宝 王滨 JIANG Yan;CAO Yanan;LIU Xuezhou;XU Yongjiang;LI Dejun;SHI Bao;WANG Bin

作者机构：中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室山东青岛266071 烟台市海洋经济研究院山东烟台264000 青岛市黄岛区渔业技术推广站山东青岛266400 

出 版 物：《水产科学》 (Fisheries Science)

年 卷 期：2020年第39卷第2期

页      面：200-208页

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目和农业部海洋渔业可持续发展重点实验室开放课题项目(2018HY-XKQ01-04) 国家现代农业产业技术体系专项资金项目(CARS-47) 山东省支持青岛海洋科学与技术试点国家实验室重大科技专项(2018SDKJ0501-2) 中国水产科学研究院黄海水产研究所基本科研业务费专项资金资助项目(20603022018021) 

主　　题：许氏平鲉 仔鱼 稚鱼 幼鱼 肠道微生物群 核心菌群 

摘      要：采集常规饲养的健康许氏平鲉1日龄仔鱼,9、20日龄稚鱼,54、95日龄幼鱼,运用Illumina MiSeq PE300平台,对其肠道微生物的16S rDNA V3~V4可变区进行高通量测序,共获得1039个运算分类单位、667个属。在丰度高于1%的菌属水平上,野生鱼肠道菌群丰度的平均值(86%)远高于幼鱼时期的平均值(73.5%)。不动杆菌属为仔鱼、稚鱼、幼鱼肠道中最优势菌属(丰度为26.2%~45.3%);短芽孢杆菌属次之。结合共有菌属分析获得11个核心菌群,芽孢杆菌属、短芽孢杆菌属、不动杆菌属、根瘤菌属等的丰度随仔鱼、稚鱼、幼鱼生长先升后降,均在54日龄时丰度最高;弧菌属则呈现相反的趋势(0.37%~12.41%),54日龄时丰度最低。仔鱼、稚鱼、幼鱼与野生个体肠道仅有14个共有菌属,短芽孢杆菌属、Massilia的最小丰度值分别是野生个体肠道中最大丰度值的9倍和32倍,差异明显。本研究揭示了许氏平鲉仔鱼、稚鱼、幼鱼肠道菌群结构特征及其发生、发育的过程,为苗种繁育阶段肠道生理健康调控提供理论依据。