新型冠状病毒S蛋白B细胞表位的预测与分析

作     者：朱珊丽 丁宁 项丹 董海艳 薛向阳 张丽芳 ZHU Shanli;DING Ning;XIANG Dan;DONG Haiyan;XUE Xiangyang;ZHANG Lifang

作者机构：温州医科大学微生物学与免疫学教研室分子病毒与免疫研究所浙江温州325035 

出 版 物：《温州医科大学学报》 (Journal of Wenzhou Medical University)

年 卷 期：2020年第50卷第3期

页      面：173-176页

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

主　　题：新型冠状病毒 S蛋白 B细胞表位 预测 

摘      要：目的:分析新型冠状病毒(SARS-CoV-2)S刺突蛋白的二级结构并预测其可能的B细胞表位。方法:基于SARS-CoV-2 S蛋白氨基酸序列,分别采用SOPMA、GOR方法预测S蛋白的二级结构,并结合其跨膜区、亲水性、表面可及性和抗原性参数等综合分析,预测SARS-CoV-2 S蛋白可能的B细胞表位。结果:对SARS-CoV-2 S蛋白二级结构的预测表明,其二级结构中柔性区域以无规卷曲为主,少见转角。多种参数综合分析推测,其可能的优势B细胞表位位于354~360、437~445、454~471、527~537、567~582、678~685、772~779和806~818位氨基酸。结论:采用多参数预测SARS-CoV-2 S蛋白的B细胞表位,为深入研究S蛋白的功能奠定基础。