宏基因组二代测序对中枢神经系统感染性疾病诊断价值的Meta分析

作     者：石亚玮 

作者单位：兰州大学 

学位级别：硕士

导师姓名：石正洪

授予年度：2023年

学科分类：1002[医学-临床医学] 100204[医学-神经病学] 10[医学] 

主      题：宏基因组二代测序 中枢神经系统感染 诊断性试验 Meta分析 

摘      要：目的:通过对宏基因组测序(mNGS)在中枢神经系统感染性疾病(ICNS)诊断中应用的原始研究进行Meta分析,来探讨mNGS在ICNS诊断中的应用价值,为临床实践提供循证医学证据。方法:分别在中国知网(CNKI)、万方数据库(Wan Fang Database)、中国生物医学文献数据库(CBM)、维普数据库(VIP Database)、Pub Med、Embase、Web of Science、the Cochrane Library、Ovid Medline、Scopus等中英文数据库中检索mNGS应用于ICNS诊断中的相关研究,检索范围为自建库至2022年12月31日。根据纳入排除标准进行文献筛选,使用QUADAS-2量表对纳入研究进行质量学评价。提取文献的一般信息、研究设计相关特征、研究对象特征、mNGS特征以及真阳性(TP)、假阳性(FP)、假阴性(FN)、真阴性(TN)等数据内容。使用Meta Disc 1.4软件进行异质性检验,排除阈值效应后使用Stata 16软件对纳入原始研究进行统计处理,按照病原体类型的不同分别计算合并后的敏感度(SEN)、特异度(SPE)、阳性似然比(PLR)、阴性似然比(NLR)、诊断比值比(DOR)并绘制各自的森林图,同时绘制综合受试者工作特征(SROC)曲线,计算SROC曲线下面积(AUC)。进行异质性检验,通过敏感性分析评价该研究的稳定性,通过亚组分析和Meta回归分析探讨异质性来源,通过Deek’s漏斗图评价发表偏倚,通过Fagan图评价临床适用性。结果:共获得文献8998篇,排除重复文献,按照纳入排除标准筛选后最终纳入54篇文献中的62组原始数据。使用QUADAS-2量表进行质量评价显示原始研究质量较高。mNGS在ICNS中总的合并SEN、SPE、PLR、NLR、DOR、AUC分别为0.75、0.92、9.0、0.27、0.89,mNGS在病毒性感染中的合并SEN、SPE、PLR、NLR、DOR、AUC分别为0.49、0.91、5.6、0.56、10、0.70,mNGS在结核性感染中的合并SEN、SPE、PLR、NLR、DOR、AUC分别为0.63、0.99、61.3、0.38、162、0.98,mNGS在细菌性感染中的合并SEN、SPE、PLR、NLR、DOR、AUC分别为0.69、0.83、4.1、0.37、11、0.83,mNGS在真菌性感染中的合并SEN、SPE、PLR、NLR、DOR、AUC分别为0.76、0.98、43.0、0.24、177、0.98。亚组分析和Meta回归分析提示样本量、检测前是否经验性用药、研究人群为成人或儿童、测序平台及测序范围是该Meta分析可能的异质性来源。结论:mNGS在中枢神经系统感染性疾病中整体诊断价值较高;在结核性和真菌性感染中诊断价值很高,细菌性感染中诊断价值中等,病毒性感染中诊断价值一般。