一种基于药效团模型的小分子生成方法、设备及介质

专利申请号：CN202210584466.5

公 开 号：CN114913938B

发 明 人：李敏 周韧易 朱慧敏 

代 理 人：长沙市融智专利事务所(普通合伙)熊开兰

代理机构：长沙市融智专利事务所(普通合伙)

专利类型：发明专利

申 请 日：20230407

公 开 日：20220527

专利主分类号：G16C20/50

关 键 词：药效团模型 解码器 特征向量 药物设计 特征提取模型 分子数据库 先导化合物 分子筛选 缓解药物 神经网络 随机采样 训练样本 药物研发 编码器 替代物 图表示 小分子 构建 配体 研发 匹配 数据库 虚拟 筛选 试验 替代 应用 优化 联合 

摘      要：本发明公开了一种基于药效团模型的小分子生成方法、设备及介质，方法：使用全连接图表示药效团模型；使用基于图神经网络的特征提取模型，从药效团模型的全连接图中提取药效团模型的特征向量；从指定的潜变量分布中随机采样获得潜变量；将潜变量和药效团模型的特征向量输入到预先训练好的解码器中，生成得到与药效团模型匹配的分子；其中训练好的解码器，是通过使用训练样本对变分自编码器训练得到的解码器。本发明能够应用于基于配体的药物设计、基于受体的药物设计、先导化合物优化、为耐药寻找替代物以及用于构建虚拟筛选的分子数据库而替代大规模联合数据库的分子筛选，减少盲目的试验工作，节省药物研发的时间和成本，缓解药物研发的压力。