一种采用ITS序列识别黄檀属和紫檀属木种的方法

专利申请号：CN201611236897.3

公 开 号：CN106636412A

发 明 人：海凌超 陈满英 胡汉志 周少英 王红强 谭嘉力 

代 理 人：王洪娟

代理机构：广州市越秀区海心联合专利代理事务所(普通合伙)

专利类型：发明申请

申 请 日：20170510

公 开 日：20161228

专利主分类号：C12Q1/68(20060101)

关 键 词：紫檀属 变异位点 软件构建系统 抽提试剂盒 序列信息 进化树 特征位 比对 测序 抽提 核酸 引物 裁剪 拼接 分辨 鉴别 筛选 发现 

摘      要：本发明公开了一种采用ITS序列识别黄檀属和紫檀属木种的方法，包括以下步骤：(1)选取黄檀属和紫檀属木种，采用核酸抽提试剂盒抽提，获得黄檀属和紫檀属木种的DNA；(2)以步骤(1)获得的DNA为模板，依次加入引物ITS4和ITS5进行PCR扩增，得到PCR产物，将PCR产物进行测序，获得ITS序列；(3)将步骤(2)得到的ITS序列，进行拼接和裁剪后比对后发现变异位点，从变异位点中筛选出能鉴别黄檀属和紫檀属的特征位点；(4)采用MEGA6.0软件构建系统进化树，结果表明，ITS的序列信息能分辨出黄檀属和紫檀属的木种。该方法可以将ITS序列作为DNA条形码，识别黄檀属和紫檀属木种。