设计目标区域特异性液相探针的方法和系统

专利申请号：CN201610204253.X

公 开 号：CN107292125A

发 明 人：张浩 李振宇 马升升 李红玉 李建康 黄慧强 申丹 蒋慧 张建国 

代 理 人：李志东

代理机构：11201 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙)

专利类型：发明专利

申 请 日：20171024

公 开 日：20160401

专利主分类号：G06F19/20(20110101)

关 键 词：探针 目标区域 筛选 属性参数 设计目标 构建 合并 延伸 

摘      要：本发明公开了设计目标区域特异性液相探针的方法和系统，其中该方法包括以下步骤：(1)将目标区域向上下游延伸预定长度，以便获得经过处理的目标区域，所述经过处理的目标区域是由数量为Wnum的窗口构成的；(2)针对经过处理的目标区域构建获得初始探针集；(3)对初始探针集进行第一筛选；(4)确定经过第一筛选的探针集中每一条探针的探针属性参数；(5)基于探针属性参数，对经过第一筛选的探针集进行第二筛选；(6)确定经过第二筛选的探针集中每一条探针的分值Pscore；(7)针对每个窗口，基于Pscore值确定一条最优探针；(8)合并所有窗口的最优探针。利用该方法能够快速、高效地设计获得目标区域的特异性液相探针。