基于复空间多视角特征融合的膜蛋白亚细胞位置定位方法

专利申请号：CN201310227091.8

公 开 号：CN103324933A

发 明 人：於东军 胡俊 杨健 吴小伟 沈红斌 戚湧 唐振民 杨静宇 

专利类型：发明申请

申 请 日：20130925

公 开 日：20130608

专利主分类号：G06K9/46(20060101)

关 键 词：亚细胞 蛋白质序列 近邻分类 视角特征 证据理论 融合 蛋白 氨基酸组成成分 位置定位方法 并行方式 并行组合 得分矩阵 鉴别特征 特征向量 特征组合 位置定位 相关变换 主成分 准确率 成复 优化 抽取 噪音 分析 

摘      要：本发明公开了一种基于复空间多视角特征融合的膜蛋白亚细胞位置定位方法。首先提取蛋白质序列的伪氨基酸组成成分(PseAAC)特征和基于自相关变换的位置特异性得分矩阵(PSSM-ACT)特征；其次，使用并行方式，将这两种特征组合成复空间中的特征向量；第三，使用广义的主成分分析(GPCA)方法对并行组合后的复特征进行降维，以去除噪音；最后，使用基于优化证据理论的K近邻分类器(OET-KNN)对融合后的特征进行分类，从而确定亚细胞位置。该方法的优点：一是采用复空间多视角特征融合技术，有效地抽取蛋白质序列的鉴别特征；二是使用了基于优化证据理论的K近邻分类器，提高了膜蛋白亚细胞位置定位的准确率。