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整合拓扑属性和功能的蛋白质生物网络模体识别方法

整合拓扑属性和功能的蛋白质生物网络模体识别方法

专利申请号:CN201310307364.X

公 开 号:CN103514381B

发 明 人:骆嘉伟 李光辉 王伟胜 江海 刘智明 蔡洁 

代 理 人:黄美成

代理机构:43114 长沙市融智专利事务所

专利类型:授权发明

申 请 日:20160518

公 开 日:20130722

专利主分类号:G06F19/18(20110101)

关 键 词:模体 整合 蛋白质相互作用 生物网络 识别方法 拓扑属性 一种 蛋白质 大规模数据 语义相似性 本体论 短语 聚集系数 综合评估 假阳性 健壮性 网络模 显著性 信息和 生物学 识别 基因 准确 出发 公开 

摘      要:本发明公开了一种整合拓扑属性和功能的蛋白质生物网络模体识别方法,本发明从模体的生物学意义出发,通过整合边聚集系数和GO短语的语义相似性来综合评估蛋白质相互作用的生物显著性,提出了一种整合拓扑属性和功能的蛋白质生物网络模体识别方法(Ecc-GOSS)。本发明实现简单,只需根据PPI信息和基因本体论信息就能够较准确地识别大量的具有生物意义的网络模体,且对蛋白质相互作用大规模数据中普遍存在的比例较高的假阳性具有很好的健壮性。

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