目的性腺发育不良(DSD)其遗传诊断的传统方法是基于临床信息,进行单基因测序来确认遗传病因。因为性腺发育不良的遗传病因有较高的异质性,且不同疾病的临床表现又高度相似,通过单基因检测来明确遗传学病因极具挑战。本研究旨在开发基于二代测序的性腺发育不良诊断方法,并将其诊断率与单基因测序进行对比。方法选取32例经过传统单基因测序的性腺发育不良病人,对其基因检测结果进行单盲处理。从这些病人的外周血中提取DNA,针对80个与性腺发育相关的基因,通过ampliseq方法进行鞭向扩增,经PGM平台测序后分析。结果通过二代测序的方法,32例病人中9例获得了明确的遗传学诊断,阳性率为28.1%,高于单基因测序(10%)。12个致病性变异被检出,分布于SRD5A2,KAL1,NR0B1,GNRHR,AR和PRO KR2基因。在另外5例病人(15.6%)中,临床意义不明的变异被检出,分布于WDR11,BMP4,DM RT1,SEMA3A,AKR1C4 and NR5A1基因。此外,SRD5A2缺乏症的病人呈现出基因型-表型关联,这在此前并未报道。结论本研究支持二代测序是性腺发育不良遗传学诊断的有效方法。
目的对45例威廉姆斯综合征(Williams-Beuren Syndrome,WBS)疑似患者进行DNA拷贝数变异分析,明确其遗传缺陷。方法以45例WBS疑似患者为研究对象,经知情同意后采集每个先证者及其父母的外周血,提取基因组DNA,应用Affymetrix Genome Wide Human SNP Array 6.0芯片与荧光定量PCR检测患者及其父母的基因组DNA拷贝数情况,用短串联重复序列结合变性聚丙烯酰胺凝胶电泳明确发生缺失突变染色体的亲本来源。结果全基因组SNP芯片的拷贝数分析结果显示:所有45例患者在染色体7q11.23的区域均发生杂合性缺失。其中42例患者缺失范围约1.5Mb,3例患者缺失范围约1.8Mb。选取缺失区域内的两个单拷贝基因,在WBS核心家系中进行定量PCR,结果显示:患者均存在该基因的缺失而父母不携带缺失突变。缺失亲本来源分析的结果中,缺失突变来自父源的有23例,母源的有19例,比例约为1,说明突变的发生不存在遗传偏倚。结论采用人类全基因组SNP芯片结合荧光定量PCR可以对临床疑诊WBS的患儿进行遗传检测,为临床明确诊断、指导治疗及遗传咨询提供依据。
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