菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)是我国最重要的滩涂贝类之一,具有肉质细嫩、味道鲜美、营养丰富、物美价廉等优点,是一种人们喜食的大宗海产贝类,也是我国南北方沿海广泛养殖的滩涂经济贝类。本研究采集了我国南北沿海菲律宾蛤仔不同地理群体,评估了各群体形态性状对活体重和软体重的影响,发现其形态特征呈现出不规律的南北交替聚类现象,构建了基于荧光标记的SSR分型技术体系,开发了88个基于高分辨率溶解曲线(HRM)技术的多态性SNP位点,综合运用SSR、SNP、COI、16S r RNA及简化基因组测序技术揭示了我国菲律宾蛤仔不同地理群体的遗传多样性和结构分化特征,发现菲律宾蛤仔大部分地理群体有效群体数目(Ne)较小,不同群体间COI基因存在多个共享单倍型,南北方群体间遗传分化不显著,具有显著的遗传同质性,通过IBD分析表明群体间遗传分化和地理距离之间不存在线性回归关系,研究结果证实菲律宾蛤仔地理群体间存在种质混杂现象,可能与我国菲律宾蛤仔南苗北养的产业模式有关,上述研究结果为我国菲律宾蛤仔的种质遗传资源保护和遗传育种提供了重要的基础信息和科学依据。
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