珍珠贝可分泌珍珠质,形成高质量的珍珠,具有重大的经济价值。当前,在基因组尤其是转录组水平对其遗传和生理进程开展研究极为必要。然而,海洋贝类相关数据及资源比较有限,尤其是珍珠贝方面。在此,我们对四种珍珠贝即马氏珠母贝、珠母贝、大珠母贝和企鹅珍珠贝(Pinctada fucata,Pinctada margaritifera,Pinctada maxima and Pteriapenguin)的转录组进行了测序,组装,注释及对比。利用Illumina HiSeq 2000高通量测序,四种珍珠贝分别获得了约25.9～27.0M reads,2.33～2.43G个碱基。序列组装和序列对比(e-value<0.00001,NR and Swiss-Prot database)后,得到注释的unigenes(≥200 bp)分别为26,420～33,882条。在此基础上,预测得到CDSs分别为26,341～33,844条,并且对所注释的unigenes分别进行了GO,COG和KEGG的聚类。此外,鉴于生长相关性状在水产养殖动物中的重要性,还预测得到了71个生长因子及其受体相关的基因。对比这些结果表明四种珍珠贝的聚类分布基本一致,并且这些数据可以相互验证和补充。本研究为珍珠贝基因发现和表达建立了很好的数据库资源,也为贝类功能基因组和比较基因组提供了平台。
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