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180 篇 会议

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8 篇 rna干扰
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机构

19 篇 中国海洋大学
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14 篇 大连海洋大学
14 篇 广西北部湾海洋生...
13 篇 宁波大学
13 篇 中国科学院海洋研...
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12 篇 广东海洋大学
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9 篇 广东省海洋生物技...
8 篇 浙江万里学院
8 篇 汕头大学
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6 篇 中国科学院南海海...
5 篇 海南大学
5 篇 广西大学
5 篇 广东省珍珠养殖与...
5 篇 南昌大学
4 篇 国家海洋设施养殖...

作者

14 篇 喻达辉
14 篇 郭唐荣隽
14 篇 白丽蓉
13 篇 王培
13 篇 郭颖
12 篇 闫喜武
12 篇 朱若琳
12 篇 陈薇薇
10 篇 郑怀平
8 篇 邓岳文
8 篇 李琪
7 篇 聂鸿涛
7 篇 刘保忠
7 篇 霍忠明
6 篇 张洪宽
6 篇 柯才焕
6 篇 郇聘
6 篇 郭宝英
5 篇 张跃环
5 篇 尤仲杰

语言

175 篇 中文
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基于基因组的蚶类血红蛋白的起源与演化研究

基于基因组的蚶类血红蛋白的起源与演化研究

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中国动物学会·中国海洋湖沼学会贝类学分会换届大会暨第二十一次全国贝类学术讨论会

作者：章伟峰曾启繁王师包永波浙江万里学院宁波大学中国海洋大学

蚶科贝类(蚶类)是少数具有血红蛋白(Hemoglobin,Hb)的软体动物类群之一,与脊椎动物相比,贝类Hb基因及其蛋白聚合形式表现出丰富的多样性。然而,对于其起源进化及聚合形式的演化机制仍缺乏深入了解。本研究完成了蚶类主要代表属5个种的... 详细信息

蚶科贝类(蚶类)是少数具有血红蛋白(Hemoglobin,Hb)的软体动物类群之一,与脊椎动物相比,贝类Hb基因及其蛋白聚合形式表现出丰富的多样性。然而,对于其起源进化及聚合形式的演化机制仍缺乏深入了解。本研究完成了蚶类主要代表属5个种的基因组测序,并通过比较基因组学分析探究了蚶类Hb的起源与进化。研究表明,蚶类祖先分化产生于约4亿年前,基因组中与离子转运、活性氧代谢、细胞增殖调控相关的基因家族发生显著扩张。蚶类保留了古老的两侧对称动物祖先染色体核型,同时不同蚶类物种内发生了不同程度的转座子扩增。蚶类中存在着"单Hb基因簇"和"多Hb基因簇",前者可能是后者一个Hb基因通过单次基因转座产生。染色体共线性分析显示,蚶类与脊椎动物两者肌红蛋白(Myoglobin,Mb)侧翼区域具有明显的共线相似性。进一步结合系统发育分析,表明脊椎动物与无脊椎动物的Hb可能起源于Mb基因所在染色体上的一个Mb-like基因。类似于脊椎动物,蚶类Hb也遵循了由单体或低聚化的祖先向携氧效率更高的四聚体或多聚体结构进化的规律,并保留了完整的演化路径。蛋白结构分析表明,预测的蚶类Mb和Hb的共同祖先通过聚合界面IF1形成同源二聚体,而异源四聚体Hb则在此基础上通过新演化出的IF2界面形成四聚。研究结果初步探究了蚶科贝类血红蛋白的起源和演化机制,揭示了脊椎动物与无脊椎动物Hb在分子水平上具有相似的进化路径,为进一步探究Hb的起源和功能演化奠定了坚实的基础。

关键词：蚶血红蛋白起源进化结构多聚化

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鲍配子识别基因VERL的种内变异与受精功能研究

鲍配子识别基因VERL的种内变异与受精功能研究

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中国动物学会·中国海洋湖沼学会贝类学分会换届大会暨第二十一次全国贝类学术讨论会

作者：罗晗娇骆轩游伟伟柯才焕福建省海洋生物遗传与育种重点实验室厦门大学海洋与地球学院

精子和卵子的表面具有相互作用的配子识别蛋白,这些蛋白质通常具有多态性,导致受精过程中配子亲和力的差异。鲍鱼的精子顶体蛋白lysin及其卵黄膜受体VERL是最具特征的配子识别系统之一。然而,目前关于VERL的种内变异及其等位基因对受精... 详细信息

精子和卵子的表面具有相互作用的配子识别蛋白,这些蛋白质通常具有多态性,导致受精过程中配子亲和力的差异。鲍鱼的精子顶体蛋白lysin及其卵黄膜受体VERL是最具特征的配子识别系统之一。然而,目前关于VERL的种内变异及其等位基因对受精率的影响的研究仍然有限。因此,本研究报告了皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai Ino)和西氏鲍(*** Gmelin)的VERL基因的全长序列。通过将重测序数据中的核苷酸多态性解析为单倍型,发现VERL编码区的前两个重复单元展现出较高的等位基因多样性。对这一区域进一步的种内变异分析表明,皱纹盘鲍的三个地理种群之间以共享单倍型为主,等位基因间并未显示显著的地理分化特征。然而,在西氏鲍中,VERL等位基因分为两个主要分支,并且雌性与雄性之间的VERL基因型匹配程度对受精率有显著影响。总体而言,本研究揭示了这两种鲍配子识别基因VERL的种内变异模式,并探讨了西氏鲍VERL等位基因之间的功能差异。这些发现为未来深入研究受精的分子机制以及提升鲍鱼繁殖效率的选育工作提供了重要支持。

关键词：皱纹盘鲍西氏鲍配子识别蛋白 VERL 受精

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中国蚌类超级条形码与系统发育基因组学

中国蚌类超级条形码与系统发育基因组学

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中国动物学会·中国海洋湖沼学会贝类学分会换届大会暨第二十一次全国贝类学术讨论会

作者：黄晓晨周春花欧阳珊吴小平南昌大学生命科学学院

物种的准确界定和识别对于理解生物多样性的演变和群落对环境变化的反应至关重要。蚌类是健康淡水生态系统的重要组成,极易受环境变化威胁导致其种群明显衰退。然而,贝壳的形态趋同和表型可塑性使得物种鉴定或存在问题,亟需构建一套经... 详细信息

物种的准确界定和识别对于理解生物多样性的演变和群落对环境变化的反应至关重要。蚌类是健康淡水生态系统的重要组成,极易受环境变化威胁导致其种群明显衰退。然而,贝壳的形态趋同和表型可塑性使得物种鉴定或存在问题,亟需构建一套经复核凭证标本、形态变异鉴定准确、更加高效的标准DNA参考序列。本研究通过广泛取样,基于基因组浅层测序技术构建包含父系和母系线粒体基因组及nr DNA序列的超级条形码数据集,解决多种基因片段不能互相兼容的弊端;整合贝壳形态对中国蚌类进行物种界定和分类检视。结果显示,基于COI序列的一代DNA条形码,序列差异达到了常用的3%遗传距离阈值标准并不一定能作为划定蚌类有效物种的依据,杂交渐渗和不完全谱系分选现象会影响基于条形码的近缘物种鉴定结果,这需要进一步有效整合基于全面采样的形态变异和核基因组数据,在群体基因组水平探讨分类疑难物种的群体遗传分化式样。研究结果为蚌类物种保护和资源利用提供标准数据和分类鉴定基础。

关键词：基因组浅层测序线粒体基因组单核苷酸多态性隐存种群体遗传结构

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滤食性牡蛎体内中隐藏的病毒多样性及其高度协调的群落结构

滤食性牡蛎体内中隐藏的病毒多样性及其高度协调的群落结构

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中国动物学会·中国海洋湖沼学会贝类学分会第二十次全国贝类学术讨论会

作者：姜敬哲农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室中国水产科学研究院南海水产研究所

由于病毒具有高度的变异性和广泛的宿主多样性,在海洋环境中的发挥着关键作用。当前已有许多关于海水中游离病毒的研究报道,但存在于海洋动物体内的病毒在很大程度上却被忽视了。牡蛎是近岸海洋生态系统中的关键物种,作为一种重要的海... 详细信息

由于病毒具有高度的变异性和广泛的宿主多样性,在海洋环境中的发挥着关键作用。当前已有许多关于海水中游离病毒的研究报道,但存在于海洋动物体内的病毒在很大程度上却被忽视了。牡蛎是近岸海洋生态系统中的关键物种,作为一种重要的海水养殖品种和高效的滤食性贝类,牡蛎养殖在为我国水产行业发展做出重要贡献的同时,还在碳固定、水质净化、和为海洋生物提供栖息地等方面发挥着重要作用。然而人们对其在海洋病毒传递和近岸海洋微生态环境调控中发挥的作用还一无所知。本研究报告了全球首个牡蛎病毒组数据集(DOV),它包含728,784个非冗余的病毒操作分类单元(v OTU,长度≥800 bp)和3,473个高质量的新型病毒基因组,使得人们得以首次全面认识香港牡蛎(Crassostrea Hongkongensis)中的病毒多样性及其群落结构。我们使用多种方法证明了栖息在牡蛎体内的病毒拥有巨大的多样性,并且发现它们与海洋或其他栖息地的病毒有着显著不同。尤其是在牡蛎中发现了非常多样的新型圆环病毒基因组,说明牡蛎可能是圆环病毒的潜在热点宿主。值得注意的是,牡蛎中多样的病毒种类并不是随机的,而是一个可以在组成和功能水平上对宿主及外部环境的变化做出反应、且组织有序的生态群落。本研究成果使已知牡蛎相关病毒的数量增加了数万倍,为牡蛎病毒病研究提供了重要数据支持,突出了滤食性双壳类在海洋病毒和噬菌体资源开发利用中重要意义。

关键词：香港牡蛎双壳类软体动物病毒组圆环病毒病毒群落结构

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栉孔扇贝（Chlamys farreri）无氧代谢机制及其高温胁迫响应研究

栉孔扇贝（Chlamys farreri）无氧代谢机制及其高温胁迫响应研究

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中国动物学会·中国海洋湖沼学会贝类学分会换届大会暨第二十一次全国贝类学术讨论会

作者：鲍李晶晶刘志黄晓婷中国海洋大学海洋生命学院海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室

近年来,海洋暖化与极端气候事件频发等海洋环境问题对海洋生物造成严重影响。海洋生物的能量供应能力在响应温度上升带来的胁迫中发挥重要的作用。无氧代谢是热胁迫下调节生物体能量供应的重要途径,但在贝类中的研究相对较少。本研究在... 详细信息

近年来,海洋暖化与极端气候事件频发等海洋环境问题对海洋生物造成严重影响。海洋生物的能量供应能力在响应温度上升带来的胁迫中发挥重要的作用。无氧代谢是热胁迫下调节生物体能量供应的重要途径,但在贝类中的研究相对较少。本研究在栉孔扇贝(Chlamys farreri)基因组中鉴定了4条无氧代谢途径的关键酶——5个冠瘿碱脱氢酶基因(Opinedehydrogenase,CfOpDHs)、2个天冬氨酸氨基转移酶基因(Aspartateaminotransferase,CfASTs)和2个磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶基因(Phosphoenolpyruvate carboxykinase,CfPEPCKs),但在扇贝的基因组中并未发现脊椎动物葡萄糖-乳酸无氧代谢的关键酶——乳酸脱氢酶(Lactate dehydrogenase,LDH)。时空表达结果表明,CfASTs参与的天冬氨酸-琥珀酸途径在幼虫发育各时期与成体各组织中发挥重要作用;进一步分析高温胁迫后无氧代谢关键酶在栉孔扇贝外套膜、鳃丝、血淋巴、心脏、横纹肌以及消化腺6个主要组织的表达情况,结果表明CfASTs在6种组织中表达量维持较高水平,但与对照组的差异不显著,CfOpDH1/3在横纹肌中显著上调表达,CfPEPCK1在6种组织中均显著上调表达。综上所述,我们推测CfPEPCK1催化的葡萄糖-琥珀酸途径是热胁迫条件下贝类无氧代谢的主要途径,而CfOpDH3催化的葡萄糖-冠瘿碱途径在横纹肌中作为无氧代谢的补充,同时CfASTs相对稳定的高水平表达对AST基本功能的维持至关重要。本研究对无氧代谢关键酶进行了全面系统地分析,对理解贝类的能量供应机制具有重要意义。

关键词：热胁迫无氧代谢栉孔扇贝磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶葡萄糖-琥珀酸途径

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MicroRNA-1985通过靶向MNK1增强虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)对聚肌胞苷酸刺激的氧化还原能力

MicroRNA-1985通过靶向MNK1增强虾夷扇贝(Patinopecten yessoensi...

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中国动物学会·中国海洋湖沼学会贝类学分会换届大会暨第二十一次全国贝类学术讨论会

作者：于凌慧邓慧琦刘少华夏楗榀郝振林尹东红湛垚垚常亚青沈阳农业大学生命科学学院大连海洋大学农业农村部北方海水增养殖重点实验室

为探究miRNA-靶基因轴是否参与了贝类对病原体相关分子模式(PAMP)诱导的氧化应激的响应,我们克隆并鉴定了虾夷扇贝(Patinopectenyessoensis)一个新的丝裂原活化蛋白激酶相互作用激酶1(MNK1)同源基因的全长c DNA。验证了miR-1985与PyMNK... 详细信息

为探究miRNA-靶基因轴是否参与了贝类对病原体相关分子模式(PAMP)诱导的氧化应激的响应,我们克隆并鉴定了虾夷扇贝(Patinopectenyessoensis)一个新的丝裂原活化蛋白激酶相互作用激酶1(MNK1)同源基因的全长c DNA。验证了miR-1985与PyMNK1之间的相互作用关系。在此基础上,探讨了miR-1985和PyMNK1对聚肌胞苷酸poly(I:C)(一种典型的与病毒相关的PAMP)刺激的反应,并初步剖析了miR-1985/PyMNK1轴在poly(I:C)刺激下在扇贝中可能发挥的分子功能。结果表明1)PyMNK1的全长c DNA为5354bp,在软体动物中具有高度的序列保守性。2)MiR-1985与PyMNK1的3'-UTR结合并负调控PyMNK1在***中的表达。3)PyMNK1可能通过结合超氧化物歧化酶(SOD)的启动子而抑制其相对表达。4)PyMNK1沉默和miR-1985过表达都会促进SOD在***中的表达和酶活性。5)miR-1985/PyMNK1轴可能通过提高SOD/CAT轴的活性参与了刺激后36-48 h对poly(I:C)的反应。本研究的所有观察结果表明,***可通过miR-1985/PyMNK1/SOD/CAT级联反应提高其氧化还原能力,从而减轻PAMP诱导的氧化应激。

关键词：丝裂原活化蛋白激酶相互作用激酶1(MNK1) miR-1985 虾夷扇贝聚肌胞苷酸刺激氧化应激

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中国圆田螺和中华圆田螺的系统分类及群体遗传学研究

中国圆田螺和中华圆田螺的系统分类及群体遗传学研究

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中国动物学会·中国海洋湖沼学会贝类学分会换届大会暨第二十一次全国贝类学术讨论会

作者：张莹莹黄晓晨周春花欧阳珊吴小平南昌大学生命科学学院

中国圆田螺(Cipangopaludina chinensis)和中华圆田螺(Cipangopaludina cathayensis)隶属于田螺科,具有重要的经济价值。但由于两种螺类贝壳形态相似,且均广泛分布于我国各地,其物种有效性和分类问题一直存疑。本研究采集国内不同地区... 详细信息

中国圆田螺(Cipangopaludina chinensis)和中华圆田螺(Cipangopaludina cathayensis)隶属于田螺科,具有重要的经济价值。但由于两种螺类贝壳形态相似,且均广泛分布于我国各地,其物种有效性和分类问题一直存疑。本研究采集国内不同地区的中国圆田螺和中华圆田螺地理种群,结合贝壳几何形态学、多位点分子标记和线粒体基因组数据,探讨两种圆田螺的物种有效性和群体遗传结构。结果表明,依据螺旋部与壳口高度比值、壳形等形态特征划分的中国圆田螺和中华圆田螺,地标点法显示两者贝壳形态差异不显著;两种圆田螺分为两大线粒体谱系,与形态学物种特征不能对应,核基因显示两物种遗传差异没有达到物种分化,核质不一致现象可能是由于河流之间具有连通性,物种基因渐渗杂交所导致。本研究支持将中国圆田螺和中华圆田螺视为同一个物种,中华圆田螺为中国圆田螺的同物异名。中国圆田螺20个地理种群遗传结构整体分为两大谱系,遗传分化显著,具有较高的核苷酸多样性和单倍型多样性,地理距离促使种群间出现较大的遗传分化。中国圆田螺种群地理种群扩张趋势不明显,种群规模相对稳定,种质资源保护良好。

关键词：田螺科圆田螺属系统发育遗传多样性

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扇贝壳闭合力性状的测定与遗传解析

扇贝壳闭合力性状的测定与遗传解析

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中国动物学会·中国海洋湖沼学会贝类学分会换届大会暨第二十一次全国贝类学术讨论会

作者：黄晓婷曾祥意隋明益杨祖晶刘志李旭东中国海洋大学海洋生命学院海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室

扇贝是双壳贝类中具有较大闭壳肌的种类之一,其营养丰富、味道鲜美,是优质"蓝色食物"的重要组成部分,具有很高的经济价值。但因缺乏无损高效的闭壳肌性状测定技术,导致闭壳肌性状的测评与遗传育种工作进展缓慢。本研究首先利... 详细信息

扇贝是双壳贝类中具有较大闭壳肌的种类之一,其营养丰富、味道鲜美,是优质"蓝色食物"的重要组成部分,具有很高的经济价值。但因缺乏无损高效的闭壳肌性状测定技术,导致闭壳肌性状的测评与遗传育种工作进展缓慢。本研究首先利用拉力计建立了扇贝壳闭合力无损高效测定技术,获得包括总力、平均力、最大力、闭壳时间四项评价指标;分析发现栉孔扇贝生长性状与壳闭合力指标呈正相关,其中闭壳肌重同四项壳闭合力指标均呈显著正相关(P <0.05),糖原含量以及精氨酸、亮氨酸及缬氨酸均同壳闭合力指标呈显著正相关(P <0.05),栉孔扇贝壳闭合力四项指标均同高温耐受时间呈显著正相关(P <0.05),低盐胁迫导致栉孔扇贝壳闭合力下降,而适度增加盐度会提高壳闭合力。对四项壳闭合力指标进行全基因组关联分析(Genome wide association study,GWAS),共检测到319个与壳闭合力性状相关的SNP位点,并根据连锁不平衡信息在位点上下游100 kb范围内鉴定到1003个候选基因,经过富集分析发现,这些基因与能量代谢、神经传递、免疫应激、闭壳肌收缩等功能相关,通过蛋白互作网络鉴定到49个高联通度基因,其中肌球蛋白轻链激酶(Myosin light chain kinase,MYLK)基因、肌动蛋白结合Rho激活蛋白(Actin-binding Rho activating protein,ABRA)基因、组蛋白脱乙酰酶4(Histone deacetylase 4,HDAC4)基因在壳闭合力大小差异扇贝闭壳肌中显著差异表达(P <0.05),其中MYLK和ABRA在扇贝闭壳肌收缩过程中发挥正调节作用,而HDAC4则可能起到抑制作用。以上研究结果将丰富扇贝经济性状测评技术体系,也为其他贝类良种选育提供了技术支持和理论参考。

关键词：扇贝壳闭合力糖原 GWAS 功能基因

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皱纹盘鲍食物转化率性状解析及基因组选育研究

皱纹盘鲍食物转化率性状解析及基因组选育研究

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中国动物学会·中国海洋湖沼学会贝类学分会换届大会暨第二十一次全国贝类学术讨论会

作者：游伟伟于文超尹资恒骆轩柯才焕厦门大学海洋与地球学院海水养殖生物育种全国重点实验室(厦门大学)

鲍是我国重要的海水养殖经济贝类,也是少有的投饲型养殖贝类,海带和龙须菜是其主要饵料。当前饲料成本占据鲍养殖总成本的一半以上,且近两年海藻价格波动极大,养殖成本居高不下,因此培育高食物转化率品种以降低饵料成本刻不容缓。本研... 详细信息

鲍是我国重要的海水养殖经济贝类,也是少有的投饲型养殖贝类,海带和龙须菜是其主要饵料。当前饲料成本占据鲍养殖总成本的一半以上,且近两年海藻价格波动极大,养殖成本居高不下,因此培育高食物转化率品种以降低饵料成本刻不容缓。本研究建立了鲍食物转化率性状的大规模个体测评设施和方法,通过测评实验发现,皱纹盘鲍的剩余采食量(Residual feed intake,RFI)和饲料效率(Feed efficiency ratio,FER)在个体之间差异显著,RFI为中高等遗传力(0.32-0.41),FER为高等遗传力(0.52-0.60),二者均有很好的选育潜力。针对养殖模式、温度、饵料等因素对皱纹盘鲍食物转化率的表型特征及遗传特征进行分析,结果表明鲍的FER性状对各种因素变化的敏感度较低,个体性状值排名较为稳定,基于该性状作为目标性状进行遗传改良,更适用于当前的养殖模式和育种研究。利用40K鲍液相芯片对皱纹盘鲍的FER和RFI性状进行了全基因组关联分析,共检测到25个显著的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)与FER相关、32个显著的SNPs与RFI相关,并基于基因组选择方法构建了高食物转化率选育群体,与对照组相比选育后代FER性状效果提高显著。本研究的开展对我国鲍鱼产业的健康发展和降低养殖风险具有重要作用。

关键词：鲍食物转化率性状测评 GWAS

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基于蛋白质组学揭示三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)外套膜和珍珠囊的生物矿化和免疫应答机理

基于蛋白质组学揭示三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)外套膜和珍珠囊...

引用

中国动物学会·中国海洋湖沼学会贝类学分会第二十次全国贝类学术讨论会

作者：王贺李雪男轩兴荣冯上乐申晓雅陈一格付元帅白志毅李文娟上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室上海海洋大学上海市水产动物良种创制与绿色养殖协同创新中心上海海洋大学上海市水产养殖工程技术研究中心

在淡水珍珠的生产过程中,外套膜小片经过一系列复杂的生理生化过程会形成珍珠囊,最终会形成珍珠。珍珠囊作为免疫诱导生物矿化的一个重要发生部位,其分子调控机制尚不清楚。本研究中我们使用蛋白质组学方法鉴定三角帆蚌外套膜和珍珠囊... 详细信息

在淡水珍珠的生产过程中,外套膜小片经过一系列复杂的生理生化过程会形成珍珠囊,最终会形成珍珠。珍珠囊作为免疫诱导生物矿化的一个重要发生部位,其分子调控机制尚不清楚。本研究中我们使用蛋白质组学方法鉴定三角帆蚌外套膜和珍珠囊的差异蛋白,并讨论其形成过程中的生物矿化和免疫应答机理。通过ITRAQ技术和生物信息学分析,获得外套膜和珍珠囊之间的差异蛋白共有1871个。其中,珍珠囊与外套膜外膜之间有74个差异蛋白,珍珠囊与外套膜内膜之间有112个差异蛋白,外套膜外膜和内膜之间有124个差异蛋白。通过富集分析发现,生物矿化相关的差异蛋白主要富集在钙信号、肌动蛋白细胞骨架调控和内质网加工相关的信号通路。免疫相关的差异蛋白主要富集在Notch, Hippo, NF-κB和TGF-β的信号通路。同时,我们利用q RT-PCR验证了6个生物矿化相关蛋白和4个免疫相关蛋白的表达。我们的研究有助于进一步了解珍珠形成和免疫反应的机制,对今后研究优质淡水珍珠的生产和淡水珍珠产业的发展具有长远意义。

关键词：三角帆蚌珍珠囊外套膜生物矿化免疫应答

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