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主题

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  • 3 篇 支持向量机
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  • 3 篇 密度泛函
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机构

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  • 6 篇 中国科学院上海药...
  • 6 篇 浙江大学
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  • 3 篇 上海科技大学
  • 3 篇 苏州大学
  • 3 篇 南昌大学

作者

  • 12 篇 俞汝勤
  • 12 篇 吴海龙
  • 10 篇 陆文聪
  • 10 篇 胡勇
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  • 8 篇 蔡文生
  • 7 篇 谢丽霞
  • 7 篇 刘志
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数据驱动的药物设计方法研究
数据驱动的药物设计方法学研究
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中国化学会第30届学术年会-第二十五分会:化学信息学与化学计量学
作者: 郑明月 蒋华良 陈凯先 中国科学院上海药物研究所药物发现与设计中心 上海科技大学生命科学与技术学院
当前,各种生物医药数据以前所未有的速度增长,如何更好的利用这些数据和信息,深入理解药物作用的复杂生物过程,提高先导化合物发现的效率,并提升候选化合物的安全性和有效性,是目前和今后创新药物研发的重要研究内容。我们主要围绕药物... 详细信息
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基于核磁共振的代谢组方法结合多元曲线分辨探索心肌缺血的生物标记
基于核磁共振的代谢组学方法结合多元曲线分辨探索心肌缺血的生物...
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中国化学会第30届学术年会-第二十五分会:化学信息学与化学计量学
作者: 张欣 张卓勇 首都师范大学
心肌缺血症状的判别对于冠状动脉疾病的诊断和治疗方案的选择至关重要。代谢组在生物和医药领域,尤其是生物探针的探寻领域逐渐发挥出引入注目的作用。采用代谢组的方法探索心肌缺血相关的生物探针,将能够有助于准确判断相关疾病,... 详细信息
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化学计量学二阶校正结合三维荧光光谱法用于红旱莲中槲皮素与芦丁的同时定量分析
化学计量学二阶校正结合三维荧光光谱法用于红旱莲中槲皮素与芦丁...
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中国化学会第30届学术年会-第二十五分会:化学信息学与化学计量学
作者: 方焕 吴海龙 谷惠文 胡勇 刘志 尹小丽 谢丽霞 俞汝勤 湖南大学化学生物传感与计量学国家重点实验室
红旱莲别名湖南连翘、黄花刘寄奴等,系藤黄科金丝桃属植物黄海棠的全草,具有凉血止血、平肝消肿、散结排脓、清热解毒等功效。研究表明,红旱莲中含有多种黄酮成分,主要为芦丁、槲皮素、金丝桃苷、山奈酚、异槲皮苷等,现代药理研究报道... 详细信息
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太赫兹时域光谱结合偏最小二乘对不同沙源地样品分类的研究
太赫兹时域光谱结合偏最小二乘对不同沙源地样品分类的研究
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中国化学会第30届学术年会-第二十五分会:化学信息学与化学计量学
作者: 刘盼盼 张卓勇 潘宝林 魏明建 朱若华 张欣 首都师范大学化学系 首都师范大学资源环境与旅游学院
我们提出了一种利用透射太赫兹时域光谱与化学计量学中偏最小二乘分类建模相结合的方法对取自不同沙漠中的不同粒径的砂样进行了分类研究。本研究中我们把测得的透射太赫兹时域光谱吸收光谱,首先经过移动窗口拟合多项式求导和直接正交... 详细信息
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基于反应规则的生物合成途径设计
基于反应规则的生物合成途径设计
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中国化学会第30届学术年会-第二十五分会:化学信息学与化学计量学
作者: 吴玲 邓喆 涂伟忠 丁邵珍 胡黔楠 中国科学院天津工业生物技术研究所
在合成生物的理性设计中,生物合成途径的设计是非常关键性的一个环节。一条完整的生物合成途径往往涉及了多个复杂的生物合成反应,每一个生物合成反应又对应了一种化学结构之间的转化方式,涉及到不同元件和功能模块。化合物的生物合... 详细信息
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分子动力模拟化学反应中的增强采样方法研究
分子动力学模拟化学反应中的增强采样方法研究
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中国化学会第30届学术年会-第二十五分会:化学信息学与化学计量学
作者: 程涛 荆志峰 辛亮 向衍 孙淮 上海交通大学化学化工学院
高浓度(压力)条件下的化学反应不能用量子力计算得到的小分子间若干个基元反应的势能面来准确描述。因为在这样条件下进行的化学反应是大量数目的基元反应的集合,涉及许多反应物、产物、中间体。我们必须考虑自由能而不仅仅是能量... 详细信息
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嘧啶类抑制剂与CDK2和CDK9选择性结合机理的理论研究
嘧啶类抑制剂与CDK2和CDK9选择性结合机理的理论研究
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中国化学会第30届学术年会-第二十五分会:化学信息学与化学计量学
作者: 孔晓天 李有勇 侯廷军 Huiyong Sun Peichen Pan Dan Li 苏州大学功能纳米与软物质学院 浙江大学药学院
在本研究中,我们采用传统分子动力模拟、MM/GBSA能量分析、拉伸动力和伞形采样等多种计算模拟手段探索了两个2,4,5-取代嘧啶类抑制剂与CDK9和CDK2选择性结合的分子机理。模拟的结果表明,这两个衍生物对CDK9具有更好的结合能力主要... 详细信息
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蛋白质大规模构象变化的计算模拟
蛋白质大规模构象变化的计算模拟
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中国化学会第30届学术年会-第二十五分会:化学信息学与化学计量学
作者: 王进安 于玉琪 邵强 朱维良 中国科学院上海药物研究所药物发现与设计中心
蛋白质功能与其结构以及结构的变化密切相关,而蛋白质结构的大规模变化及功能机制模拟一直是分子模拟研究工作者所面临的巨大挑战。为此,我们发展了一种将简振模式分析和伞取样模拟方法相结合的分子模拟新方法NUMD(图1),实现了蛋白质大... 详细信息
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基于长程无序蛋白链尺寸关系的粗粒化分子动力模拟
基于长程无序蛋白链尺寸关系的粗粒化分子动力学模拟
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中国化学会第30届学术年会-第二十五分会:化学信息学与化学计量学
作者: 李茂东 孙潭霖 刘志荣 北京大学定量生物学中心
单分子FRET实验可以获取蛋白变性过程的尺寸和能量信息,直接得到的是标记端点距离〈R〉。以往工作中通常使用高分子Gaussian chain Model将其转换成蛋白回转半径〈R〉,再用于后续分析。但是,这种做法的理论基础并不清楚。我们建立了粗... 详细信息
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Drug@home:三维分子相似性的分布式计算平台
Drug@home:三维分子相似性的分布式计算平台
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中国化学会第30届学术年会-第二十五分会:化学信息学与化学计量学
作者: 张景广 潘晨旭 李洪林 华东理工大学信息科学与工程学院 华东理工大学药学院
SHAFTS是本课题组发展的基于化学特征匹配和形状相似性评价的三维分子相似性评价算法,现已被广泛应用于虚拟筛选、骨架跃迁及多向药理研究。但是该方法在针对超大规模数据库的实际运用中,面临着巨大计算资源需求的问题。为解决上述现... 详细信息
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