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关于Metadynamics三种边界校正方法的比较
关于Metadynamics三种边界校正方法的比较
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中国化学会第30届学术年会-第十九分会:化学中的量子与经典动力学
作者: 向衍 孙淮 上海交通大学化学化工学院
近十几年来,Metadynamics[1]已经得到广泛应用,可以方便地计算模拟体系的自由能曲线,克服反应坐标上的过高自由能位垒造成的采样不足的问题。Metadynamics需要选取一定数量的体系自由度作为变量集(CV),按下式添加有偏势能V(s,t)=∑t... 详细信息
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Apo-HPPK的构象空间网络模拟研究
Apo-HPPK的构象空间网络模拟研究
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中国化学会第30届学术年会-第十九分会:化学中的量子与经典动力学
作者: 高恺夫 华中师范大学物理科学与技术学院
HPPK是一种重要的激酶和潜在的抗生素靶点,其作用是催化细菌体内重要生命物质叶酸合成的一步反应。在HPPK的催化过程,HPPK先结合MgATP,再结合HP,然后催化反应才能发生;其MgATP的结合位点位于loop 3下,而HP的结合位点位于loop 2下:... 详细信息
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FH2O-光剥离过程的反应和非反应Feshbach共振现象
FH2O-光剥离过程的反应和非反应Feshbach共振现象
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中国化学会第30届学术年会-第十九分会:化学中的量子与经典动力学
作者: 马建毅 郭华 四川大学原子与分子物理研究所 新墨西哥大学
结合FH2O高精度的负离子和性体系势能面,我们用量子动力学的方法研究了FH2O-的光剥离过程,在其光电子能谱上可以看到很宽的和很窄的两种吸收峰,分别对应于可反应的和非反应的Feshbach共振行为。可反应的共振态在F+H2O→HF+OH反应过渡... 详细信息
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[Py2N(tBu)2Mn(H2O)2]2+催化水氧化机理的理论研究
[Py2N(tBu)2Mn(H2O)2]2+催化水氧化机理的理论研究
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中国化学会第30届学术年会-第十九分会:化学中的量子与经典动力学
作者: 李英英 廖荣臻 华中科技大学化学与化工学院
Lee[1]等人报导了1[LMn(H2O)2]2+(L=Py2N(tBu)2)能在pH为12.2,电压为+1.23 V条件下催化水氧化生成氧气。本文主要通过密度泛函方法研究其催化反应的机理。计算表明,1在实验条件下首先失去两个质子和一个电子形成2[LMnⅢ(OH)2]+... 详细信息
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苯酚光解离动力学的全维多态半经典的轨迹模拟研究
苯酚光解离动力学的全维多态半经典的轨迹模拟研究
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中国化学会第30届学术年会-第十九分会:化学中的量子与经典动力学
作者: 许雪飞 郑晶晶 阳科 Donald G.Truhlar DepartmentofChemistry ChemicalTheoryCenterandSupercomputingInstituteUniversityofMinnesota 清华大学燃烧能源中心
生命的基本组成单元核酸碱基和氨基酸等分子自身具有一定的光稳定特性,使之可以对抗一定程度的UV辐射。其机制在于此类分子的激发态可通过超快的非辐射弛豫通道迅速返回到分子的基态。苯酚分子作为氨基酸分子酪氨酸的模型分子,其光解离... 详细信息
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分子动力学模拟研究温度对吡啶离子液体性质的影响
分子动力学模拟研究温度对吡啶离子液体性质的影响
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中国化学会第30届学术年会-第十九分会:化学中的量子与经典动力学
作者: 康贤取 王玉 周司文 张良伟 朱光来 安徽师范大学原子与分子物理研究所
离子液体是指在常温下呈液态的由阴阳离子组成的化合物,其特点是蒸汽压小,不易挥发,熔点低,液态范围宽,热稳定性好等,作为一种新型的绿色溶剂正受到越来越多的研究者的关注[1,2]。温度对离子液体的许多物理化学性质,如密度、黏度、导电... 详细信息
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CO2在一价阳离子RHO型分子筛上的吸附
CO2在一价阳离子RHO型分子筛上的吸附
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中国化学会第30届学术年会-第十九分会:化学中的量子与经典动力学
作者: 赵丹 韩克利 陈晓芳 中国科学院大连化学物理研究所 沈阳师范大学
Palomino[1]、Lozinska[2,3]等人在实验发现,一价碱金属离子型RHO分子筛对CO2/CH4的选择性非常高,尤其在低于1bar的条件下。本工作通过密度泛函方法(DFT)计算不同碱金属阳离子在不同落位上对吸附的影响,并模拟不同温度和压强下,二... 详细信息
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血红素化学的电子迁移反应:以亚氯酸盐歧化酶为例
血红素化学中的电子迁移反应:以亚氯酸盐歧化酶为例
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中国化学会第30届学术年会-第十九分会:化学中的量子与经典动力学
作者: 苏璟璇 陈世稆 北京理工大学化学学院原子分子簇科学教育部重点实验室 光电转换材料理论与技术重点实验室
在血红素化学,电子迁移(ET)现象是非常重要的,但通常它却很难被实验技术手段表征。我们运用密度泛函理论(DFT)计算,优化得到了亚氯酸盐歧化酶(Cld)催化分解过氧乙酸(PAA)时的电子迁移的过渡态。计算表明,亚氯酸盐歧化酶催化过氧乙酸... 详细信息
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用路径积分刘维尔动力学方法研究分子振动光谱
用路径积分刘维尔动力学方法研究分子振动光谱
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中国化学会第30届学术年会-第十九分会:化学中的量子与经典动力学
作者: 张志军 陈子飞 刘剑 北京大学化学与分子工程学院理论与计算化学研究所
在研究分子振动光谱时,对于非谐效应显著的体系,简正模式分析和经典分子动力学方法往往有所不足[1]。路径积分刘维尔动力学方法(path integral Liouville dynamics,PILD)[2],是我们最近发展的一种基于虚时路径积分的动力学新方法,它能... 详细信息
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对羟基苯基丙酮酸双氧化酶及其抑制剂的研究
对羟基苯基丙酮酸双氧化酶及其抑制剂的研究
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中国化学会第30届学术年会-第十九分会:化学中的量子与经典动力学
作者: 刘昌春 孙笑 乔青安 鲁东大学化学与材料科学学院
对羟基苯基丙酮酸双氧化酶(4-Hydroxyphenylpyruvate dioxygenase,HPPD)是植物体正常生长所必需的质体醌和生育酚生物合成路径的关键酶。本文介绍了除草剂的新靶标HPPD及相关抑制剂的结构、活性以及开发成功的新品种。研究了HPPD的作... 详细信息
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