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DNA序列,结构与别构效应
DNA序列,结构与别构效应
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中国化学会2014年大分子体系理论、模拟与计算研讨会
作者： 古婵 杨立江 高毅勤 北京大学化学与分子工程学院理论与计算化学研究所 北京大学生物动态光学成像中心
蛋白质与DNA的结合和相互作用在基因表达和调控中具有十分重要的生物学意义。而在蛋白质与DNA的结合中DNA本身的结构扮演重要的角色。目前对基因调控过程的研究多数集中在蛋白质上,而将DNA作为一个单纯的结合位点,少有目光投向DNA自身... 详细信息
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膜器室内的浸润性转变
膜器室内的浸润性转变
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中国化学会2014年大分子体系理论、模拟与计算研讨会
作者： 郭坤琨 肖文甲 湖南大学材料科学与工程学院
从理论上采用Helfrich曲面弹性理论和自洽场理论复合的模型研究了仿生生物膜内囊括的几种水相体系。膜内的水相体系经过相分离形成两相,而膜囊泡的稳态和亚稳态形状也可以获得。尤为重要的是,在膜器室内观察到完全浸润,部分浸润到非浸... 详细信息
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GALAMOST:GPU加速的大尺度分子动力学模拟软件包
GALAMOST:GPU加速的大尺度分子动力学模拟软件包
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中国化学会2014年大分子体系理论、模拟与计算研讨会
作者： 朱有亮 吕中元 孙昭艳 中国科学院长春应用化学研究所 吉林大学理论化学研究所
GALAMOST是一个多功能的分子动力学模拟程序包[1],它被设计成尽可能多地利用GPU的计算效能。除了普通的分子动力学模拟的功能外,它被发展成为一个可以针对高分子体系进行粗粒化分子动力学模拟的工具。它包含了一些最新报道的模拟技术,... 详细信息
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主链富勒烯聚合物与磷脂膜作用的模拟研究
主链富勒烯聚合物与磷脂膜作用的模拟研究
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中国化学会2014年大分子体系理论、模拟与计算研讨会
作者： 田文得 苏州大学软凝聚态物理及交叉研究中心
随着纳米技术和合成方法的发展,越来越多的新材料被制作出并用于生物医药领域。[1]一个重要的例子是,富勒烯被广泛用于高分子医用材料的改性。理解材料和生物高分子,比如DNA、RAN、膜蛋白、生物膜间,间的作用规律对提高相关材料的生物... 详细信息
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缠结高分子体系中分子扩散的动态MC模拟
缠结高分子体系中分子扩散的动态MC模拟
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中国化学会2014年大分子体系理论、模拟与计算研讨会
作者： 刘冬梅 王健 卢宇源 石彤非 安立佳 张汉壮 吉林大学物理学院 中国科学院长春应用化学研究所
借助动态Monte Carlo模拟,我们研究了不同链长的单分散和二分散缠结高分子熔体的分子链动力学。通过控制测试链周围的分子链长和运动形态,定量地获得了高分子链的扩散系数和标度率,从而有效地表征了管长涨落效应(CLF)和约束松弛效应(CR... 详细信息
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剪切场下棒状高分子的粘度行为
剪切场下棒状高分子的粘度行为
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中国化学会2014年大分子体系理论、模拟与计算研讨会
作者： 陈继忠 徐晓雷 安立佳 中科院长春应用化学研究所
三段剪切粘度行为[1],即流体在低剪切强度呈现剪切变稀行为(Region I),在中等剪切呈现类牛顿流体行为(Region II),而在高剪切的又呈现剪切变稀行为(Region III),是常见于如液晶高分子,棒状胶体,碳纳米管及棒状病毒等棒状体系。对于大多... 详细信息
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DNA序列,结构与别构效应
DNA序列,结构与别构效应
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2014年大分子体系理论、模拟与计算研讨会
作者： 古婵 杨立江 高毅勤 北京大学化学与分子工程学院理论与计算化学研究所 北京大学生物动态光学成像中心 100871
蛋白质与DNA 的结合和相互作用在基因表达和调控中具有十分重要的生物学意义。而在蛋白质与DNA 的结合中DNA 本身的结构扮演重要的角色。目前对基因调控过程的研究多数集中在蛋白质上，而将DNA 作为一个单纯的结合位点，少有目光投向DNA... 详细信息
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聚合反应中环化效应的统计热力学
聚合反应中环化效应的统计热力学
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中国化学会2014年大分子体系理论、模拟与计算研讨会
作者： 王海军 王云明 顾芳 洪晓钟 王海军 河北大学化学与环境科学学院 河北大学物理科学与技术学院
基于统计力学原理对聚合反应体系中的内环化效应及其相应的聚集态结构和相态结构予以研究,主要考察了线性、超支化以及可凝胶化三类聚合反应体系中环化结构的相关特征,旨在揭示了环化结构对体系关联特征的影响.进而通过描述聚合反应的... 详细信息
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模型胶体链的玻璃化转变理论
模型胶体链的玻璃化转变理论
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中国化学会2014年大分子体系理论、模拟与计算研讨会
作者： 陈康 张博凯 苏州大学软凝聚态物理及交叉研究中心 固体微结构国家实验室
非线性Langevin方程理论是研究玻璃化转变的微观理论之一。它已经被应用于研究胶体和各种聚合物的玻璃化动力学。这个理论的基础是建立在粒子或胶体体系上的。对具有链结构的体系,采用了简单公式套用的方法。为此,我们扩展了胶体的非线... 详细信息
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受限半刚性高分子刷的轴向对称破缺
受限半刚性高分子刷的轴向对称破缺
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中国化学会2014年大分子体系理论、模拟与计算研讨会
作者： 汤九州 张兴华 严大东 中国科学院化学研究所 北京交通大学理学院 北京师范大学物理系
我们发展了一种基于蠕虫链模型的单链平均场模拟方法,用以研究半刚性高分子刷的压缩效应。对于基于高斯链模型的自洽场理论,高分子刷的压缩会导致分子链各向同性的形变。但是,在高接枝密度情形下,即使对于柔性的分子刷,依旧会形成向列... 详细信息
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