根据构建的日本血吸虫7d童虫消减cDNA文库real time PCR验证结果,选择一段童虫高表达的EST,RACE扩增全长cDNA后克隆测序,进行生物信息学分析。同源性分析表明该基因为日本血吸虫新基因,完整的开放阅读框(ORF)长2058bp,编码685AA,理论分...
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根据构建的日本血吸虫7d童虫消减cDNA文库real time PCR验证结果,选择一段童虫高表达的EST,RACE扩增全长cDNA后克隆测序,进行生物信息学分析。同源性分析表明该基因为日本血吸虫新基因,完整的开放阅读框(ORF)长2058bp,编码685AA,理论分子量为79519.9,等电点为5.22。氨基酸序列的功能结构域搜索发现该基因具有fibrillin家族的特征,含多个表皮生长因子功能域(EGF like domain)命名为Sj-fibrillin,Genbank登陆号:1067183。选取人、小鼠、大鼠、线虫等13个物种的fibrillin蛋白进行进化树分析,结果显示血吸虫的fibrillin蛋白在进化上与哺乳动物更接近。氨基酸保守功能域分析表明该基因具有一个表膜相关的结构域(pvs28);结构预测表明该蛋白与人的fibrillin蛋白在结构上也有一定的相似性。
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