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家鸡细胞因子信号传导抑制因子(SOCS1)基因的克隆及其组织表达

家鸡细胞因子信号传导抑制因子(SOCS1)基因的克隆及其组织表达

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四川省动物学会第九次会员代表大会暨第十届学术研讨会

作者：徐雪李娟王亚军四川大学生命科学学院

细胞因子信号传导抑制蛋白(suppressor of cytokine signaling,SOCS)家族是一类由细胞产生并反馈性阻断细胞因子信号转导过程的负反馈调节因子。SOCS家族由八个成员组成:cytokine-inducible SH2-containing protein(CIS)和SOCS1-7。SOCS1最早于1997年由3个不同的研究小组分别用不同的方法发现。作为SOCS家族中的重要成员,近年来研究发现SOCS1在多种免疫反应中发挥重要作用,参与多种细胞因子的信号转导及免疫细胞的形成与分化,对机体固有免疫和适应性免疫反应起到重要调控作用。针对SOCS1的研究日渐受人关注。目前的研究认为SOCS1主要通过3种方式对细胞因子信号通路进行调节:1)通过其SH2结构域与靶蛋白磷酸化的酪氨酸残基结合,使Janus Kinase(JAK)激酶的N末端失活而抑制信号转导。此外,SOCS1的N-末端含有有激酶抑制区(KIR,Kinase inhibitory region),可直接抑制JAK酪氨酸激酶的活性;2)SOCS1启动子含有STAT转录因子(Signal Transducers and Activators of Transcription protein)的结合位点,从而可抑制STAT与受体位点的结合;3)通过SOCS盒可与elongin B、elongin C、cullin-5和RING-box-2(RBX2)相互作用,募集E2泛素转移酶,进而促进所结合蛋白通过蛋白酶体依赖途径而降解。家鸡,作为模式研究动物,一直在比较内分泌学上扮演着重要角色。作为最重要的经济动物,健康养殖亦是无法回避的重要课题。本研究致力于探究SOCS1在家鸡中参与多种细胞因子的信号转导机制及其在免疫细胞形成与分化中的重要作用。我们首先以家鸡肌肉组织cDNA为模板,成功扩增家鸡socs1基因,其cDNA全长为729bp,由一个外显子组成,一共编码208个氨基酸。同时,我们亦设计特异性引物检测socs1a基因的组织分布图谱。RT-PCR结果显示socs1在家鸡肺和卵巢组织大量表达,在心脏、小肠、肾脏、肝脏、肌肉、精巢、垂体、脾、胰腺中等组织也有表达,而在大脑中却表达较少。针对家鸡SOCS1的研究有望解析SOCS1对家鸡免疫的调节作用。

关键词：家鸡 SOCS1 克隆表达分析

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家鸡血清素受体6(5-HTR6)基因克隆、组织表达分析及其功能鉴定

家鸡血清素受体6(5-HTR6)基因克隆、组织表达分析及其功能鉴定

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四川省动物学会第九次会员代表大会暨第十届学术研讨会

作者：岳建辉王亚军李娟四川大学生命科学学院

随着人类基因组计划的完成,基因组学研究已由结构基因组学过渡到功能基因组学,阐明基因功能成为人们关注重点。5-羟色胺(5-Hydroxytryptamine,5-HT)最早在血清中获得鉴定,又名血清素,广泛存在于哺乳动物组织中,特别在大脑皮层质及神经... 详细信息

随着人类基因组计划的完成,基因组学研究已由结构基因组学过渡到功能基因组学,阐明基因功能成为人们关注重点。5-羟色胺(5-Hydroxytryptamine,5-HT)最早在血清中获得鉴定,又名血清素,广泛存在于哺乳动物组织中,特别在大脑皮层质及神经突触内含量很高。作为抑制性神经递质,5-HT具有调节复杂的感觉、运动、情感和认知的功能。目前,许多治疗抑郁症和焦虑症的途径都是通过增加血清素神经递质而达到。5-羟色胺经由至少14种不同的5-羟色胺受体亚型(5-Hydroxytryptamine Receptor,5-HTR)介导其生物学效应。这些亚型主要属于5-HTR1、5-HTR2、5-HTR3、5-HTR4、5-HTR5、5-HTR6、5-HTR7七种受体类型。其中5-HTR3属于门控性离子通道受体,其余的13种受体亚型均属于G蛋白偶联受体。家鸡作为鸟类模式生物一直备受关注。本实验以家鸡脑组织cDNA为模板,扩增家鸡5-HTR6基因全长,并通过设计特异性的引物检测5-HTR6基因的组织分布特异性。为验证5-HTR6的功能,我们将扩增到的5-HTR6基因cDNA编码区构建到表达载体pcDNA3.1(+)上,在CHO细胞中,以5-HT为配体检测5-HTR6对胞内cAMP信号通路的影响。实验结果表明:1)家鸡5-HTR6基因cDNA全长为1345bp。该基因由3个外显子组成,编码433个氨基酸。2)RT-PCR结果显示5-HTR6在家鸡脑组织高表达;在心脏、小肠、肾脏、肝脏、肺、肌肉、精巢、卵巢、垂体、脾中等组织有表达,而在胰腺中未检测到PCR信号。在5-HTR6表达质粒转染的CHO细胞中,5-HT处理能够有效提升增加细胞内cAMP水平,且5-HT对受体的活化呈明显剂量依赖效应。针对家鸡5-HTR6基因的组织表达图谱与功能鉴定,将有助于阐明5-HTR6在家鸡各组织中的重要生理功能。

关键词：家鸡血清素受体6 克隆表达功能鉴定

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棘蛙亚科物种丰富度、种域及体型大小垂直分布格局

棘蛙亚科物种丰富度、种域及体型大小垂直分布格局

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四川省动物学会第九次会员代表大会暨第十届学术研讨会

作者：胡军华谢锋李成江建平中国科学院成都生物研究所

探讨和解释物种多样性的空间分布格局是生态学家和生物地理学家一直关注的问题和面临的挑战。量化物种多样性沿海拔梯度的变化格局是生物多样性理论的核心问题之一。棘蛙亚科(Anura:Dicroglossidae:Painae)是亚洲特有的两栖类群,主要分... 详细信息

探讨和解释物种多样性的空间分布格局是生态学家和生物地理学家一直关注的问题和面临的挑战。量化物种多样性沿海拔梯度的变化格局是生物多样性理论的核心问题之一。棘蛙亚科(Anura:Dicroglossidae:Painae)是亚洲特有的两栖类群,主要分布于喜马拉雅山区、横断山区、秦岭和太行山南麓以南至中南半岛北部之间的地区。现有41种,隶属12属、2族,其中棘蛙族Paini包含33个物种,拟棘蛙族Quasipaini仅含8种。最近的研究已基本理清棘蛙亚科的系统发育关系,并初步完成了历史演化过程的探讨,指出该类群是揭示历史和生态地理分布格局演化的重要指示类群。利用棘蛙亚科及其在海拔梯度上的分布范围和高程数字模型数据集,我们探讨了棘蛙物种丰富度垂直分布格局,并在大海拔梯度(0～5000m)量化了面积对物种丰富度格局的影响。我们还检验了两个假说:1)海拔梯度上的Rapoport对棘蛙亚科有效;2)棘蛙类群中存在Bergmann渐变群。在四种不同的海拔段宽度上(100 m、200 m、300 m与400 m)上,棘蛙物种丰富度都显示出沿海拔梯度的驼峰形。在物种的棘蛙族与拟棘蛙族物种丰富度随海拔梯度的变化进一步证实了这一发现但拟棘蛙族物种丰富度的峰值相对棘蛙族来说处于更低的海拔上。各海拔段面积对拟棘蛙族物种丰富度变化有着显著的影响,而对整个亚科及棘蛙族并没有。在整个海拔梯度上所有棘蛙物种形成5个明显的集合。海拔梯度上种域宽度并未随着种域中点的增加而扩大。体型大小与海拔则呈现出显著的负相关。本研究结果表明,海拔梯度上Rapoport法则并非棘蛙物种的固有属性,同时还指出Bergmann法则也不是普遍适用于两栖动物。本研究强调了,我们需要进一步探索物种丰富度格局的内在机制,特别是在宏生态上解析两栖动物多样性格局。

关键词：海拔梯度 Bergmann渐变群体型大小 Painae Paini Rapoport法则 Quasipaini 物种丰富度格局

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圈养大熊猫母兽带仔野化培训研究第一阶段

圈养大熊猫母兽带仔野化培训研究第一阶段

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四川省动物学会第九次会员代表大会暨第十届学术研讨会

作者：李德生黄炎周世强黄金燕刘巅吴代福谢浩邓林桦李仁贵张和民中国保护大熊猫研究中心

中国保护大熊猫研究中心于2010年7月开始圈养大熊猫母兽带仔的野化培训研究,选择4只已经配种的具有野外生活经验的雌性大熊猫到卧龙核桃坪野化培训基地。草草于2010年8月3日在卧龙核桃坪野化培训基地产一雄性幼仔,体重205g。在野化培训... 详细信息

中国保护大熊猫研究中心于2010年7月开始圈养大熊猫母兽带仔的野化培训研究,选择4只已经配种的具有野外生活经验的雌性大熊猫到卧龙核桃坪野化培训基地。草草于2010年8月3日在卧龙核桃坪野化培训基地产一雄性幼仔,体重205g。在野化培训期间,幼仔一直生活在半野化环境中,风吹雨打,日晒雨淋,在雪地里睡觉都一直没有感冒,幼仔一直都生长发育正常,半岁时体重达到11 600g,比其它同期的圈养大熊猫幼仔都重,也更有野性。野化培训幼仔35天时睁开眼睛,92天便发现乳牙出现。2010年9月23日,幼仔可用使用前肢爬动,移动到母兽腹部吃奶,而且随着时间的延长,幼仔的活动能力增强,活动时间增多。2010年12月12日,开始具有爬树行为,5个月以后,幼仔白天较多时间独自生活于树上,活动很少,每天下树1～2次吃奶和与母兽交流。分析认为,树上的隐蔽性和安全性更好,同时母兽可以自由觅食而不受幼仔的影响。在2010年11月至2011年1月,母兽的活动呈现出明显的规律性,即每天9～10点和15～18点处于活动高峰,24～2点有一个次高峰,而每天5～7点,11～13点和20～22点处于活动低谷。本研究首创了大熊猫幼仔与研究者的伪装隔离方法,避免了培训个体对人和人工饲养环境的依赖。初步建立了大熊猫初生幼仔到半岁幼兽的野化培训方法。探索了提高圈养大熊猫活力的新方法。初次发现了草草对果子狸的反应,收集到罕见的大熊猫追击果子狸录像,证明了大熊猫的较强的自卫还击能力。目前,野化培训已经进入第二阶段,草草和幼仔在一个更加复杂的环境进行野化培训,其面积更大,位于大熊猫的栖息地内。

关键词：大熊猫野化培训卧龙

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环境变量选择与尺度变化对物种适宜栖息地模拟的影响:以普氏原羚为例

环境变量选择与尺度变化对物种适宜栖息地模拟的影响:以普氏原羚...

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四川省动物学会第九次会员代表大会暨第十届学术研讨会

作者：胡军华蒋志刚中国科学院动物研究所中国科学院成都生物研究所

物种适宜栖息地模拟在濒危物种保护中非常有用。然而如何选择环境变量与空间尺度(分辨率)是该领域至关重要却未能有效解决的问题。以普氏原羚为例,基于10多年的野外调查数据,我们构建了栖息地适宜性分布图,并比较了利用3组不同环境变量... 详细信息

物种适宜栖息地模拟在濒危物种保护中非常有用。然而如何选择环境变量与空间尺度(分辨率)是该领域至关重要却未能有效解决的问题。以普氏原羚为例,基于10多年的野外调查数据,我们构建了栖息地适宜性分布图,并比较了利用3组不同环境变量建立的竞争模型(完整、不相关和精简模型)在模拟中的差异。同时,我们探讨了适宜栖息地模拟中分辨率尺度将影响空间输出与衡量模型表现的指标的假说。海拔、最暖月份最高气温、最潮湿季节平均气温、最暖季节平均气温和等温条件等5个变量对模型的贡献最大。最大熵模型中11种方法确定的阈值存在显著差异,导致选择的潜在分布范围存在显著差异。受试者工作特征(ROC)曲线显示3个竞争模型的表现都很好。相对来说,不相关模型的表现稍差。竞争模型的预测结果间存在相关性,特别是完整模型与精简模型(r=0.889)。它们的结果表现出相似的空间格局:青藏高原东部地区为普氏原羚最适宜的栖息地。除环青海湖地区外,适宜栖息地还覆盖了邻近青海湖东北和南部的一些地区及黄土高原和河套鄂尔多斯中平原上其他一些零散的潜在分布点。6种空间分辨率尺度(1×1、2×2、4×4、8×8、16×16和32×32 km)的模拟结果有着相似空间格局,但尺度影响模型表现及空间输出结果。当尺度小于16×16 km,潜在分布面积间的差异较小,面积比率为1.00～3.58;当达到16×16 km后,面积比率不成比例地增大。随着尺度增大,交叉验证AUC值轻微下降;代表空间一致性的AUC值则小幅度波动。我们的结果使得对影响该濒危有蹄类潜在分布的环境因素的理解更为深刻,并指明分辨率尺度变化的影响,将有助于指导普氏原羚和其他珍稀濒危物种的野外调查和保护规划。

关键词：生态位模型 Procapra przewalskii 竞争适宜性模型阈值确定方法尺度影响青藏高原

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圈养林麝繁殖生物学研究

圈养林麝繁殖生物学研究

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四川省动物学会第九次会员代表大会暨第十届学术研讨会

作者：戚文华张修月岳碧松四川大学生命科学学院四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室

从1958年开始,中国陆续建立了一些林麝养殖场,例如四川的马尔康、都江堰及米亚罗养殖场,陕西的镇平养殖场,安徽的佛子陵养殖场,甘肃的兴隆山养殖场和上海的崇明岛养殖场。在过去的50年中,麝类的生境、摄食、驯化、泌香机制、活体取麝及... 详细信息

从1958年开始,中国陆续建立了一些林麝养殖场,例如四川的马尔康、都江堰及米亚罗养殖场,陕西的镇平养殖场,安徽的佛子陵养殖场,甘肃的兴隆山养殖场和上海的崇明岛养殖场。在过去的50年中,麝类的生境、摄食、驯化、泌香机制、活体取麝及管理已经取得了较大的成就,但对林麝繁殖特征进行系统报道的较少。本研究采用直接观察和录像回放等方法记录、统计了马尔康和米亚罗2个养殖场最近4年雌麝的繁殖行为及其他与繁殖相关的数据,通过one-way ANOVAs、Duncan test和t test分析妊娠期、发情周期和哺乳期的规律,单双胎率、初生仔麝体重及其死亡规律、初配和经产雌麝的配怀率和空怀率、雌麝交配和产仔季节的频次分布以及两个养麝场雌麝繁殖参数的差异。研究结果表明:林麝为季节性多次发情动物。雌麝的发情周期、妊娠期和产仔间隔期分别为16.81 d±0.73 d(n=36),182.85 d±0.81 d(n=90),366.03 d±3.52 d(n=120)。雌麝交配期一般在10月下旬至翌年2月,集中在11～12月,占84.94%±1.56%,高峰期在11月(占51.59%±2.58%)。初配雌麝的平均交配日期为12月的6.32日(±0.75),经产雌麝的平均交配日期为11月的29.69日(±0.57)。产仔期从4月底开始到8月底结束,主要在5和6月(占90.59%±2.18%),高峰期在5月(占53.01%±0.97%)。初配雌麝的平均产仔日期为6月6.75日(±1.01),经产雌麝的平均产仔日期为5月的30.55日(±0.70)。初配雌麝在第2和3年配怀仔麝。初配和经产雌麝的配怀率分别为68.65%±2.19%和73.33%±1.25%。初生雌雄仔麝性比为1.07:1(P>0.05)。仅统计到2个雌麝产3仔,占0.61%±0.35%;1个雌麝产4仔,占0.19%±0.19%。初生平均仔麝体重是518.70 g±10.31 g,范围304～775 g(n=140),雄性仔麝出生时比雌性仔麝重(521.13 g±14.75 g,n=70 vs.516.92 g±14.32 g,n=70,P=0.841)。初生仔麝体重在300～400 g之内容易死亡。仔麝出生后第一个月内的死亡率为24.97%±1.15%,而断奶前的死亡率为35.32%±0.64%。结果表明圈养林麝与野生林麝和其他麝类动物有类似的繁殖模式。

关键词：林麝繁殖仔麝死亡

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中国黑叶猴资源分布与保护现状

中国黑叶猴资源分布与保护现状

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四川省动物学会第九次会员代表大会暨第十届学术研讨会

作者：胡刚西华师范大学珍稀动植物研究所澳洲国立大学考古与人类学学院西南林业大学野生动物研究所

黑叶猴Trachypithecus francoisi广泛分布于越南北部到中国中南部北纬21°30’9°08’的片断化喀斯特森林中。上世纪90年代黑叶猴在中国分布于广西、贵州和重庆的41个隔离分布点,估计种群数量在3500～3850。其中约2200～2500只... 详细信息

黑叶猴Trachypithecus francoisi广泛分布于越南北部到中国中南部北纬21°30’9°08’的片断化喀斯特森林中。上世纪90年代黑叶猴在中国分布于广西、贵州和重庆的41个隔离分布点,估计种群数量在3500～3850。其中约2200～2500只分布于广西的23个县,约1000只分布于贵州的11个县,约300只分布于重庆的5个县。然而,近期的调查表明中其种群数量已降至约1700只,分布于22个隔离点.其中贵州约1200只分布于5个点,广西约300只14个点,重庆200只3个点。盗猎与栖息地退化是导致种群下降与分布萎缩的主要原因。广西种群已从90年代的2500只急剧减至2003年的300只左右,散布于14个隔离点,总栖息面积约516 km2。目前,栖息面积已缩减至约213 km2。盗猎与栖息地退化是导致种群下降与分布萎缩的主要原因;贵州种群数量从90年代的1100只增加到2010年的1160～1200只。但由于耕地扩大、家畜养殖、薪材消耗与水电建设等因子所导致栖息地丧失与退化,黑叶猴仅分布在大沙河等5个隔离点,总面积约912 km2;90年代黑叶猴在重庆东南的6个县较为常见,但现存种群200只仅存于金佛山等3个隔离分布点,栖息面积仅为58 km2,面临的主要威胁是耕地扩大、水电建设和旅游开发。中国黑叶猴分布范围内共有16个保护区（面积2734 km2）,保存了中国黑叶猴种群约93%。但只有一半的面积（1357 km2）有森林（含天然林和人工林）覆盖,且森林多被灌丛、草地、道路、耕地和村庄所隔离。虽然黑叶猴可在灌丛取食,并可大量采食灌木等非树食物,但其多栖息于天然阔叶林生境。黑叶猴的栖息生境估计仅为520 km2,其中约480 km2分布在这16个保护区内。贵州东北部的4个分布点与重庆南部的3个点相毗邻,可考虑在分布点之间建立生态走廊以促使隔离种群间的基因交流。此外,这7个点保存了中国黑叶猴种群约75%,可视为该物种保存的关键区域,应该给予保护的优先考虑。

关键词：保护现状分布变迁黑叶猴栖息地退化种群数量

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雌蛙的激励能改变雄性竞争的胜负结果

雌蛙的激励能改变雄性竞争的胜负结果

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四川省动物学会第九次会员代表大会暨第十届学术研讨会

作者：许飞崔建国宋晶王玉胜唐业忠中国科学院成都生物研究所

雄性之间竞争的目的主要有两个:一是竞争配偶,二是竞争资源。无尾目动物雄性之间的竞争主要通过鸣叫竞争来完成。我们的科学问题是:既然雄性之间竞争的目的很大程度上是为了获得配偶,那么雌性的存在与否对雄性之间的竞争格局有何影响?... 详细信息

雄性之间竞争的目的主要有两个:一是竞争配偶,二是竞争资源。无尾目动物雄性之间的竞争主要通过鸣叫竞争来完成。我们的科学问题是:既然雄性之间竞争的目的很大程度上是为了获得配偶,那么雌性的存在与否对雄性之间的竞争格局有何影响?之前的研究发现雌性爪蟾能发出两种功能完全相反的鸣叫,一种是处于繁殖状态的雌性发出的鸣叫,称为Rapping,能显著增加雄蛙的鸣叫,另一种是处于非繁殖状态的雌性发出的鸣叫,称为Ticking,能显著抑制雄性的鸣叫。我们将两只雄性爪蟾成对放入同一只缸中使其竞叫,再分别回放雌蛙的Rapping或Ticking的录音,分别记录每只爪蟾在成对放入前、成对放入后、以及成对放入并回放雌性鸣叫时的鸣叫时间,比较其差异。我们还记录了雄蛙的体重,分析了体重与三个阶段鸣叫时间的关系。结果表明,单独鸣叫时,成对放入的两组蛙之间的鸣叫时间无明显差异,成对放入同一缸中后,因为相互抑制,两组蛙的鸣叫时间较配对前均有减少,其中一组显著低于另一组,定义为从属组,较少抑制的定义为优势组。当回放rapping后,从属组和优势组的鸣叫均显著增加,而从属组增加更多,优势组和从属组之间鸣叫时间差异变得不显著,且约半数雄蛙在听到雌性的Rapping后反败为胜。而回放Ticking时,两雄蛙的鸣叫时间变得更短,但Ticking并未改变两雄蛙的竞争结果。这些结果表明雌性的存在对雄性的竞争结果产生显著影响。在雄性之间的竞争过程中,不同的雄性个体采取不同的策略,有的雄蛙在雌蛙鸣叫出现之前,采取保守的策略以保存实力,而在雌蛙鸣叫出现后采取激进的策略,大量增加鸣叫来吸引配偶。此外,雄蛙的体重与配对之前和配对回放时的鸣叫时间呈正相关,体重较大的雄蛙鸣叫的持续时间较长。由于雄蛙的鸣叫是一个非常耗能的过程,体重较大意味着有更多的能量可以消耗,鸣叫时间更长。在配对过程中,体重和鸣叫的时间长短并无相关性。这也说明了在雌蛙出现之前,有的雄蛙出于保存实力的原因,并没有投入所有的能量进行雄性竞争。综上,我们的结果表明,雌蛙的激励可能会改变雄蛙竞争的胜负结果,这与雄蛙采取适时竞争的策略有关。

关键词：雌蛙激励雄性竞争胜负结果

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景东臭蛙皮肤抗菌肽的分离纯化与串联质谱(MS/MS)De Novo测序

景东臭蛙皮肤抗菌肽的分离纯化与串联质谱(MS/MS)De Novo测序

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四川省动物学会第九次会员代表大会暨第十届学术研讨会

作者：刘炯宇江建平吴志军谢锋中国科学院成都生物研究所

云南景东产景东臭蛙Odorrana jingdongensis剥皮晾干后,干皮经酸性乙醇液抽提得到其分泌物并冻干保存。冻干粉重溶于磷酸钠缓冲液(pH7.0,0.06M)后,在KTATM purifierPHC 10层析系统中进行一系列层析分离,抗菌活性监测采用MH肉汤微量稀... 详细信息

云南景东产景东臭蛙Odorrana jingdongensis剥皮晾干后,干皮经酸性乙醇液抽提得到其分泌物并冻干保存。冻干粉重溶于磷酸钠缓冲液(pH7.0,0.06M)后,在KTATM purifierPHC 10层析系统中进行一系列层析分离,抗菌活性监测采用MH肉汤微量稀释法。具体纯化步骤为:先经HiPrep 16/60 Sephacryl S100 HR凝胶过滤层析,层析缓冲液为磷酸钠缓冲液(pH7.0,0.06M);活性洗脱部分稀释后上于XK 16/20 CM Sepharose FF阳离子交换柱,线性梯度洗脱,洗脱液为含NaCl的磷酸纳缓冲液(pH7.0,0.02M),NaCl含量由0M上升到0.5M;活性洗脱部分分别载于Tricorn 10/300 Source 15 RPC反相柱,线性梯度洗脱,洗脱液A为0.05%(v/v)TFA/2%(v/v)乙腈/水,洗脱液B为0.065%(v/v)TFA/80%(v/v)乙腈/水,A/B比例从8/92变化到36/64;活性洗脱部分分别载于100-5C-18 HPLC反相柱,线性梯度洗脱,洗脱液(0.1%(v/v)TFA/5%乙腈/水)中的乙腈由5%上升到60%,收集主峰,得到7种景东臭蛙抗菌肽JD1-JD7,JD2和JD6再上于100-5C-18 HPLC反相柱,等梯度洗脱并收集后半部主峰。至此,7种抗菌肽已经完全纯化。经micrOTOF-QIITMESI-Qq-TOF质谱测得单一同位素分子量[M](Da,精度5ppm)分别为3363.7957,2557.4377,2031.1407,2077.1287,3817.1037,2599.5197和4858.6607。抗菌肽经DTT还原二硫键并经碘乙酰胺烷基化和经100-5C-18 HPLC反相柱纯化后,直接喷入micrOTOF-Q IITMESI-Qq-TOF质谱仪的ESI源,手工挑选一级质谱(MS)的多正电荷母离子进行二级质谱(MS/MS)分析,二级质谱数据在DataAnalysis软件中去卷积后导入Biotools软件中,并以臭蛙属所有物种已有的抗菌肽序列(包含mRNA序列推导出的理论序列)作为参考序列进行De Novo测序。测序结果表明,除了部分肽的氨基酸不同外,与已有的无指盘臭蛙、云南臭蛙以及绿臭蛙的部分抗菌肽序列间具有一致性。

关键词：景东臭蛙皮肤抗菌肽分离纯化 De Novo测序

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基于溯祖方法揭示出山溪鲵属物种不同的分化模式和历史种群动态

基于溯祖方法揭示出山溪鲵属物种不同的分化模式和历史种群动态

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四川省动物学会第九次会员代表大会暨第十届学术研讨会

作者：吕彬郑渝池曾晓茂中国科学院成都生物研究所中国科学院研究生院

许多谱系地理学研究的结果显示地质构造运动及更新世冰期的反复扩张和消退对种群的遗传结构和历史动态具有显著的影响。青藏高原的急剧抬升引发了其东缘地区强烈的造山运动,而该地区在随后的更新世冰期时成为许多物种的冰期避难所。先... 详细信息

许多谱系地理学研究的结果显示地质构造运动及更新世冰期的反复扩张和消退对种群的遗传结构和历史动态具有显著的影响。青藏高原的急剧抬升引发了其东缘地区强烈的造山运动,而该地区在随后的更新世冰期时成为许多物种的冰期避难所。先前的对于该区域的谱系地理研究过于依赖分子钟方法,而且对地质运动造成种群分化模式并不明确,而种群历史动态的研究还很有限。本研究以分布于青藏高原东缘山区的山溪鲵属物种为例,探讨其谱系地理格局和历史种群动态,基于近几年发展起来的溯祖理论来检验青藏高原隆起及更新世冰期气候变化促进分化的假说。结果表明位于该地区的各个物种的都具有明显的种群地理结构,有限的基因流呈现出方向偏好性。种群历史动态结果表明不同的海拔高度的物种可能受到的不同时期的冰期影响。通过生境建模,我们发现高海拔物种的生活环境更加寒冷和干燥,并具有更大的变化性,与之相反,低海拔物种的生境比较温暖和潮湿,变异性较小,这种环境的异质性很可能是造成物种分化的重要原因。我们将物种的形态特征和生境因子描绘在系统树上进行祖先状态重建后,发现高海拔分布的物种与低海拔分布物种相比具有形态上的特殊性。通过溯祖模拟,发现如果按照分子钟推算的时间来标定分化结点,所有物种的谱系地理假设都不成立,但是当我们将分化时间假定为青藏高原的近期隆起开始(3.6～2.5百万年)时,模拟结果能够支持我们的假设,这一结果表明青藏高原隆起及更新世冰期环境的变化促进了种群的分化,支持假说成立,也提示我们对于比较新的物种及种群要谨慎使用分子钟。另外模拟结果也显示,山溪鲵种群分化模式并不是单纯的隔离分化,有的种群分化可能是迁移和殖民模式,而起源中心的推测也支持这一结果。因此我们在进行谱系地理研究时,还是要尽可能的多做一些物种进行比较,不能以一概全。

关键词：青藏高原溯祖理论种群动态谱系地理分化

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